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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 向genbank提交序列之后，收到一信件，需要提供有关样品的信息？有人遇到过么？救赎
汕头大学海洋科学接受调剂
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feiye2214

木虫 (正式写手)

[求助] 向genbank提交序列之后，收到一信件，需要提供有关样品的信息？有人遇到过么？救赎


小弟前天向genbank提交了一个cDNA全序列，今天收到回信，需要再提供一些信息，我第一次提交序列，各位大侠帮忙看看，到底是要什么东西？
难道是：样品采集的地点，采集方式？获得cDNA的方式和方法？跑胶照片？
求救赎！下面是信件的内容，照片也是
Dear GenBank Submitter:

Please find your assigned Accession Number(s) in the letter below.

Please provide a strain, isolate, clone, specimen voucher, OR an
alpha-numeric code used in your laboratory to distinguish your
submission(s) from others in the database. Note we are requesting
that you provide only one of these identifiers, if available.

For more information, please see:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK53701/

Send this information to: gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov

Thank you and we look forward to hearing from you soon.

Sincerely,

The GenBank Submissions Staff
Bethesda, Maryland USA
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wangjunnan

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1楼 2011-08-10 11:14:54
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stone2239

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
10楼: Originally posted by xiying8009 at 2012-02-21 15:38:04
楼主，我又核对了一遍序列，方向和起始啥的都没有问题。
而且线粒体COI基因按理说应该全是编码区。
我把blast出来的近缘序列放在MEGA里边校对，也出现了好多*，但是这些序列在NCBI里边的CDS区域都翻译的好好呀！这 ...

密码子的通用性及特殊性问题。是你选错遗传密码表了吧？线粒体基因组的密码表和通用密码表是不一样的。
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18楼2015-06-23 01:27:12
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zemin_fang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
silicare(金币+1): 谢谢参与 2011-08-10 11:52:53
feiye2214(金币+5): 2011-08-10 12:05:37
主要是提供你递交的序列原始来源菌株的名称，如果是克隆，给你的克隆起个名字，以保证你的序列名称在genbank'中是唯一的。
赞一下(1人) 回复此楼
2楼2011-08-10 11:23:13
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feiye2214

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by zemin_fang at 2011-08-10 11:23:13:
主要是提供你递交的序列原始来源菌株的名称，如果是克隆，给你的克隆起个名字，以保证你的序列名称在genbank'中是唯一的。

我的是乌贼的mRNA,用试剂盒提取RNA，反转录，5’3’RACE，最后获得的全序列装到pMD 18-T载体转到DH5a菌里了，我是不是给这个DH5a菌取个名字？谢谢
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3楼2011-08-10 11:40:15
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jinkui960

至尊木虫 (知名作家)
★ ★
adslye(金币+2): 感谢交流！祝顺利！ 2011-08-10 21:31:32
引用回帖:
3楼: Originally posted by feiye2214 at 2011-08-10 11:40:15:
我的是乌贼的mRNA,用试剂盒提取RNA，反转录，5’3’RACE，最后获得的全序列装到pMD 18-T载体转到DH5a菌里了，我是不是给这个DH5a菌取个名字？谢谢

你的序列是从乌贼里面扩增得到的，跟DH5a菌没有关系，DH5a只是一个宿主菌，你可以提供乌贼的样品编号，实在没有编号，可以自己编一个试验样品号。
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feiye2214
4楼2011-08-10 12:33:33
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