24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 4705  |  回复: 19
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

feiye2214

木虫 (正式写手)

[求助] 向genbank提交序列之后,收到一信件,需要提供有关样品的信息?有人遇到过么?救赎


小弟前天向genbank提交了一个cDNA全序列,今天收到回信,需要再提供一些信息,我第一次提交序列,各位大侠帮忙看看,到底是要什么东西?
难道是:样品采集的地点,采集方式?获得cDNA的方式和方法?跑胶照片?
求救赎!下面是信件的内容,照片也是
Dear GenBank Submitter:

Please find your assigned Accession Number(s) in the letter below.

Please provide a strain, isolate, clone, specimen voucher, OR an
alpha-numeric code used in your laboratory to distinguish your
submission(s) from others in the database. Note we are requesting
that you provide only one of these identifiers, if available.

For more information, please see:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK53701/

Send this information to: gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov

Thank you and we look forward to hearing from you soon.

Sincerely,

The GenBank Submissions Staff
Bethesda, Maryland USA
回复此楼

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

常用金属盐

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zemin_fang at 2011-08-10 11:23:13
主要是提供你递交的序列原始来源菌株的名称,如果是克隆,给你的克隆起个名字,以保证你的序列名称在genbank'中是唯一的。

你好:
     阅读你之前的帖子,感觉你在微生物方面很专业,所以想请教个问题。我向NCBI提交序列后,也收到了一封关于样品信息的回信,由于我第一次弄不太懂,能否麻烦你帮忙看一下吗!谢谢!以下是genbank的回信:
[1] Is this sequence from:

  a) a purified culture that contains only one microbial species or a vouchered specimen

  b) enrichment culture: use of selective culture media to enrich for a set
     of microorganisms with a particular phenotypic property, resulting in
     a partially purified, mixed culture. Do not choose this option
     for a purified strain or vouchered specimen.                           

  c) bulk environmental DNA (no cultures or other vouchers available):
     PCR-amplified directly from source/host DNA.

   If this is from bulk environmental DNA, was it amplified using:
          i) universal primers - amplifies DNA from a broad range of organisms
          or
          ii) species-specific primers - amplifies DNA from a single species
         
[2] Provide a clone/isolate/strain/specimen voucher or other unique identifier
for your record, using accepted biorepository acronyms where possible.  

[3] Provide additional details describing the environmental conditions and
geographic location where this sequence or organism was isolated.

Send your response to:  gb-admin@ncbi.nlm.nih.gov

If we do not hear from you by Jul  1, 2015, all of your submission(s) will
be deleted from the processing queue.

For your reference, please find your preliminary flatfile below
with the information we currently have.
17楼2015-06-22 22:07:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 20 个回答

zemin_fang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


silicare(金币+1): 谢谢参与 2011-08-10 11:52:53
feiye2214(金币+5): 2011-08-10 12:05:37
主要是提供你递交的序列原始来源菌株的名称,如果是克隆,给你的克隆起个名字,以保证你的序列名称在genbank'中是唯一的。
2楼2011-08-10 11:23:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

feiye2214

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by zemin_fang at 2011-08-10 11:23:13:
主要是提供你递交的序列原始来源菌株的名称,如果是克隆,给你的克隆起个名字,以保证你的序列名称在genbank'中是唯一的。

我的是乌贼的mRNA,用试剂盒提取RNA,反转录,5’3’RACE,最后获得的全序列装到pMD 18-T载体转到DH5a菌里了,我是不是给这个DH5a菌取个名字?谢谢
3楼2011-08-10 11:40:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jinkui960

至尊木虫 (知名作家)

★ ★
adslye(金币+2): 感谢交流!祝顺利! 2011-08-10 21:31:32
引用回帖:
3楼: Originally posted by feiye2214 at 2011-08-10 11:40:15:
我的是乌贼的mRNA,用试剂盒提取RNA,反转录,5’3’RACE,最后获得的全序列装到pMD 18-T载体转到DH5a菌里了,我是不是给这个DH5a菌取个名字?谢谢

你的序列是从乌贼里面扩增得到的,跟DH5a菌没有关系,DH5a只是一个宿主菌,你可以提供乌贼的样品编号,实在没有编号,可以自己编一个试验样品号。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

4楼2011-08-10 12:33:33
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 国自然面上和省基金B类撒花 +16 花田半亩~白 2026-04-21 16/800 2026-04-23 03:04 by 魅力紫翼
[考研] 有没有学校收留 +3 蒋昌鹏qtj 2026-04-20 3/150 2026-04-22 20:25 by 学员JpLReM
[考研] 312求调剂 +3 山河似你温柔 2026-04-22 3/150 2026-04-22 20:17 by 学员JpLReM
[考博] 华师大读博 +3 xq83 2026-04-22 5/250 2026-04-22 10:42 by xq83
[教师之家] 又一批高校组建人工智能学院 师资行吗 不是骗人吗 +5 yexuqing 2026-04-19 5/250 2026-04-22 10:01 by easeheart
[考博] 申博/考博 +4 啃面包的小书虫 2026-04-17 8/400 2026-04-21 16:26 by 啃面包的小书虫
[考研] 295分求调剂 +6 ?要上岸? 2026-04-17 6/300 2026-04-21 08:18 by Equinoxhua
[考研] 085600材料与化工调剂 5+3 孜孜不倦2002 2026-04-19 6/300 2026-04-20 21:25 by babero
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀,最好在一个月之内的,研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 7/350 2026-04-20 15:45 by 豆豆7758
[考研] 337求调剂 +3 jyz04 2026-04-18 3/150 2026-04-20 12:24 by 研可安
[考博] 申博 +3 Xyyx. 2026-04-18 3/150 2026-04-20 10:44 by YuY66
[考博] 湖南大学刘巧玲课题组2026年第二批次博士研究生招生信息 +3 南风观火 2026-04-18 5/250 2026-04-20 10:13 by 南风观火
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 294求调剂 +8 淡然654321 2026-04-17 9/450 2026-04-19 19:51 by Equinoxhua
[考研] 304求调剂 +8 castLight 2026-04-16 8/400 2026-04-19 17:14 by 中豫男
[考研] 求调剂 +6 苦命人。。。 2026-04-18 7/350 2026-04-19 16:27 by 中豫男
[考研] 接受任何调剂 +6 也就是栗子 2026-04-17 7/350 2026-04-18 17:20 by 涵竹刘
[考研] 收到复试调剂但是去不了 +8 小蜗牛* 2026-04-16 8/400 2026-04-18 11:15 by zixin2025
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
信息提示
请填处理意见