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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » NBO/AIM » NBO计算输出结果中的各个结构片段是怎样确定的？
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568268772

金虫 (正式写手)
引用回帖:
9楼: Originally posted by vigaryang at 2011-10-23 13:57:22:
就是按照Sobereva老师说的那样，用NBO=nboread外加$CHOOSE关键词人为指定。详细信息及输入文件实例可阅读NBO操作指南及百度。

楼主，不好意思，再打扰您。
     我已经照您说的做了，我遇到的问题和您遇到的一样，但是我还是没成功的定义为2个unit，而是三十多个unit，我反复的试着用choose关键词定义lone，bond等，可我得到的结果却不是2个unit，希望您能帮助我，我NBO操作指南及百度过很多遍了，理解不了，定义总是达不到2个unit，恳请您的帮助，非常感谢您！
     （附件是我的分子结构图）
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11楼2011-12-02 16:16:47
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568268771

木虫 (著名写手)
比如说一个甲苯计算nbo，怎么用choose关键词定义lone，bond呢？好像定义的不对就会把苯环分成好几个unit，请指教！
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认识小木虫们很高兴！
12楼2011-12-07 11:05:06
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vigaryang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 568268771 at 2011-12-07 11:05:06:
比如说一个甲苯计算nbo，怎么用choose关键词定义lone，bond呢？好像定义的不对就会把苯环分成好几个unit，请指教！

附件是我写的利用choose关键字对苯酚-氟化氢1:1复合物进行NBO分析的例子，包括输入文件和输出文件。如果你之前看过NBO指南，应该会清楚输入文件中各符号的含义。
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568268772 ilxxm
13楼2011-12-07 18:37:13
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568268772

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
13楼: Originally posted by vigaryang at 2011-12-07 18:37:13:
附件是我写的利用choose关键字对苯酚-氟化氢1:1复合物进行NBO分析的例子，包括输入文件和输出文件。如果你之前看过NBO指南，应该会清楚输入文件中各符号的含义。

再送鲜花一朵，问题已在您的帮助下解决了，非常感谢您，非常感谢！
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14楼2011-12-08 16:51:27
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ilxxm

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
1525993楼: Originally posted by vigaryang at 2011-12-07 18:37:13
附件是我写的利用choose关键字对苯酚-氟化氢1:1复合物进行NBO分析的例子，包括输入文件和输出文件。如果你之前看过NBO指南，应该会清楚输入文件中各符号的含义。...

您好，请问您这个输入文件，是用高斯的什么版本，gaussian 98 还是gaussian 03？
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15楼2012-09-18 10:46:48
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zhuohongying

木虫 (正式写手)
引用回帖:
1525993楼: Originally posted by vigaryang at 2011-12-07 18:37:13
附件是我写的利用choose关键字对苯酚-氟化氢1:1复合物进行NBO分析的例子，包括输入文件和输出文件。如果你之前看过NBO指南，应该会清楚输入文件中各符号的含义。...

请问楼主，遇到开壳层的体系应该怎么办啊，手册上说要分为alpha和beta两种自旋方式，但是两种自旋的LONE 和 BOND 如何确定啊？附件是从手册上抄下来的例子，求解释。
求解释.doc(24KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GIRYPCBHPMXL?p=130497
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16楼2012-09-18 13:59:55
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vigaryang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
1648886楼: Originally posted by ilxxm at 2012-09-18 10:46:48
您好，请问您这个输入文件，是用高斯的什么版本，gaussian 98 还是gaussian 03？...

gaussian 03
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17楼2012-09-18 20:17:26
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vigaryang

木虫 (正式写手)
引用回帖:
1648922楼: Originally posted by zhuohongying at 2012-09-18 13:59:55
请问楼主，遇到开壳层的体系应该怎么办啊，手册上说要分为alpha和beta两种自旋方式，但是两种自旋的LONE 和 BOND 如何确定啊？附件是从手册上抄下来的例子，求解释。
求解释.doc(24KB)
http://kuai.xunlei.com/d ...

很抱歉，我也不太清楚，没接触过开壳层计算
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zhuohongying
18楼2012-09-18 20:18:22
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zhuohongying

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
1649060楼: Originally posted by vigaryang at 2012-09-18 20:18:22
很抱歉，我也不太清楚，没接触过开壳层计算...

好吧，谢谢你！
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19楼2012-09-19 10:09:10
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907912845

铁虫 (初入文坛)
送鲜花一朵
引用回帖:
1049153楼: Originally posted by sobereva at 2011-08-08 14:19:08
geom=connectivity与判断unit没有任何关系。在NBO分析中，由BD连接的原子们会被认为是一个unit，没有BD连接的原子间即便在高斯输入文件中写了连接关系也不会产生任何作用。如果确信氢原子和旁边的一个原子能够成键， ...

老师好，想问您一下问什么用高斯优化结构时出入文件和输出文件的点群不一致呀，是因为按照输出文件的点群会使结构最稳定么，还是输入文档的图形画的比较差，但是如果我固定的是一个点群，输出文件不应该按照命令执行么，比较纠结，希望得到您百忙之中的指点~
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20楼2012-10-30 13:45:20
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