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xinji

铜虫 (小有名气)

[求助] 在运行towhee的时候出现以上错误,请问是什么原因?如何解决?

Initial Energies for Box     1
intermolecular overlap
rijsq rminsq  0.368800875564190        1.00000000000000     
rij  0.607289778906405     
chain, unit           1           1
i-pos   1.25000000000000        1.25000000000000        1.25000000000000     
jchain jj          40           4
j-pos   1.56430113353160        50.7420724992630        1.14033994793016     
getatompos           1         478
在运行towhee的时候出现以上错误,请问是什么原因?如何解决?
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043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
xinji(金币+1): 我尝试了下,可能是盒子太小了 2011-07-30 23:17:50
御剑江湖(金币+3): 谢谢 2011-07-31 19:28:45
指的是原子靠的太近了
检查你的坐标文件中,有没有原子靠的太近. 另外可能的原因是力场设置, 仔细检查有没有错误.
还有一个可能是盒子设置有问题. 处在盒子边缘的原子很有可能跟镜像盒子中的原子靠的太近.
2楼2011-07-30 22:31:27
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043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
xinji(金币+1): 我的盒子原先是20:20:20的,后来改成了100:100:100的,但感觉太大了,还需进一步调整 2011-07-30 23:19:21
御剑江湖(金币+2): 谢谢 2011-07-31 19:28:54
你的盒子大小是不是:50 50 50
3楼2011-07-30 22:32:36
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如水.101

木虫 (小有名气)

冰洁

【答案】应助回帖

xinji(金币+3): 2011-09-06 18:42:11
你的 rmin 这一项设置的大了,你是不是设了1.0d0啊?你把它改为0.4d0试试。
勇者无惧无欲则刚
4楼2011-09-06 15:48:43
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如水.101

木虫 (小有名气)

冰洁

towhee能正常运行,但是运行后的显示全部都是vphi vangle overcap:T而不显示计算的结果,这是怎么回事?请问是什么原因?如何解决?
勇者无惧无欲则刚
5楼2011-09-06 15:52:38
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