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20928140

木虫 (正式写手)

[求助] 高斯计算过渡态时的能垒总是负值

自己现在正在计算CF2ClCFClH和HO^-1发生E2消除反应的过渡态(此反应过程应该是基元反应,可以认为是强碱拔氢)。可是自己计算出来的能垒一直是负值,不知道该如何处理。过渡态有唯一虚频且较大,用IRC扫描确认无误。计算方法如下:
       刚开始用的是HF/6-31+G(d,p),发现能垒是-122.8Kj/mol,采用B3LYP/6-31+G(d,p),也是负的。计算方法是采用E(TS)-E(CF2ClCFClH)-E(HO^-1)得到的。
       哪位前辈指点一下啊?为什么是负值?
       谢谢!
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

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小红豆(金币+5): 心平气和的交流嘛 2011-07-25 22:30:32
引用回帖:
Originally posted by fatpig8832 at 2011-07-25 13:28:47:
我汗,楼上某位专家貌似没看清楚楼主的帖子啊
楼主说的是用 E(TS)-E(CF2ClCFClH)-E(HO^-1) 算出来的能垒,这样算显然是不对的...
应该用 E(TS)-E[(CF2ClCFClH)+(HO^-1)]
一般来说 E(CF2ClCFClH)-E(HO^-1) 是 大 ...

说得挺好的,也提醒了我忘了BSSE校正也可能引起楼主的问题。那就用counterpoise做一下BSSE校正好了,不过一般BSSE不会太大,2-3kcal/mol就很了不起了吧。楼主虽然没说能垒是多少,但我估计不会这么小的。但是给我提醒一个思路,还是感谢你的。
我学gaussian才不过2年半,这期间曾得到版面上好多人的指导,重要的不仅仅是个别问题的答案,而是怎样思考问题。所以有人问1+1=几的时候,我愿意给出怎么解题的思路,而不是直接回答2.在高手看来是显摆,在我自身学习的过程体会,这比答案重要。何况我所学不精,我不把我的错误摆出来,怎么有机会得到高手的纠正呢。。他人遇到的问题,我也会遇到,我如果一直用错误的方式解决而不暴露出来,怎么能得到教训呢。我也反感那个专家顾问的头衔,我只是勇于展示自己的错误想法,期望得到高手指正的机会。你的吐槽不会让我因此而不敢露怯,我会继续宣扬我的思路,以期盼有高手看不过去,进而来纠正我。
一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭,其实这是修养不足学识浅薄的一种体现,也是可恶的偏执和愚蠢的自以
11楼2011-07-25 21:22:16
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20928140

木虫 (正式写手)

哪位大侠现现身?
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2楼2011-07-23 18:58:15
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 谢谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-07-23 22:21:08
1、你确定你的反应物的稳定结构正确么?是全局最小而不是局域最小么?
2、你确定你的基组大小合适么?别忘了这里面的F、Cl都是电负性很高的,你用了足够的极化和弥散了么?
3、能垒是负值,你说用E值计算的,我能问问所谓的E值是指哪个?是E(RHF),是热力学E(tol),还是焓?还是自由能?
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3楼2011-07-23 19:54:59
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

★ ★ ★
小红豆(金币+3): 感谢交流 2011-07-25 22:31:17
1、上文第一条意指你可能找到的不是全局最小点,而且你这里还有一个手性C(手性C不影响能量),这个可能占80%
2、基组的选择,以及方法的选择是否恰当,这个可能占10%
3、第三条是指你是否考虑了热力学内能,是否做了零点能校正,这个可能占10%
4、极少情况下,实验测的活化能可以是负值(多发生在生化反应中),估计你这个反应不在此列中。
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4楼2011-07-23 20:02:27
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