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libing198968银虫 (初入文坛)
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RACE实验中的 GC-Rich 问题
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大家好,我刚开始做RACE的新兵,我用的是Clontech的SMARTer™ RACE cDNA Amplification Kit。说明书上提示说GC含量过高,不能得到预期产物,就要用Clontech 提供Advantage GC 2 Polymerase Mix (Cat. No. 639114) and PCR Kit (Cat. Nos. 639119 &639120) 来有效扩增 GC-rich模板。 我想问一下,对于植物而言,GC含量多少以上就算是GC含量过高呢? 还有就是假设预期的GC含量比较高,但真实的GC含量没有那么高,用Advantage GC 2 Polymerase Mix 来扩增会不会更加影响扩增效率呢? 求大侠指点 |
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Huobol
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我测序中得到的SMARTer II A Oligonucleotide AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT AC AGGGG AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT AC AGGGA 上面是不同时间做的5‘RACE,XXXXX分别为AGGGG和AGGGA,不太一样,虽然这对5‘RACE没有影响,毕竟后面的序列是5’UTR。既然你说“3‘端三个碱基g为RNA, 3'末端需要做磷酸化修饰”,看来我第一次做的AGGGG的确有3个连续的G。不知道本帖其他虫友有类似的测序结果吗?最重要的如果自己合成,该如何填写引物合成单啊是不是就写这个AAGCAGTGGTATCAACGCAGAGT AC AGGGG序列,末端的磷酸化修饰如何说名啊?(不能合成就算了) |

14楼2015-09-12 10:00:48
taigongzaici
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2楼2011-07-20 09:44:04
blackrose8089
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3楼2011-07-20 09:55:58
libing198968
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4楼2011-07-20 16:14:55










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liubolin945