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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 论文上两幅图是什么技术做出来的
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fanc232

新虫 (小有名气)

[求助] 论文上两幅图是什么技术做出来的

一片文献里使用到了ChIP reaction技术，就是把蛋白质和DNA复合物裂解成片段以后，用目的蛋白对应的抗体收集复合物片段，把里面的DNA分离纯化出来，PCR扩增，进一步检测等等，目的是确定目的蛋白结合在哪一种基因片段上。中间插入了这个图像，大概意思是展示几种蛋白质结合在DNA的相似区域，可是没有说这是什么做的图。
我是做生物转计算生物的，不懂这是什么技术，什么软件做出来的图。
图片在附件里。请各位达人在允许的范围内大概给我指个搜索方向，我真的非常需要知道这是什么图。先谢谢你们！


[ Last edited by fanc232 on 2011-7-15 at 16:51 ]
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我很喜欢计算机辅助药物设计
1楼 2011-07-15 16:49:52
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

Chip sequence 技术
图看得不是太清楚，按照我的经验：图中横坐标应该是基因的序列位置，纵坐标有峰的位置应该是表示为蛋白的结合位点，峰值的大小表示为统计量，统计Illumina测序的反应个数或者contig条数，具有一定的概率意义。
推荐读物：High-Resolution Profiling of Histone Methylations in the Human Genome.  Cell   2007
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fanc232
真相是最大的奢侈品
4楼2011-10-11 11:36:16
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wanhscn

木虫 (职业作家)

哲学@草根

【答案】应助回帖

原则上讲，对于生物信息学水平一般的人来说，在导出并统计数结果后，用Excel就可以画出来。而多数高手喜欢用R语言！
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真相是最大的奢侈品
5楼2011-10-11 11:39:16
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普通回帖

西瓜

荣誉版主 (知名作家)
2楼2011-07-15 23:29:52
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
再顶~
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3楼2011-07-23 16:46:55
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
★ ★
wanhscn(金币+2): 同意! 2011-10-11 23:43:50
仔细在文献里面找找吧，一般在methods里面，或者图片说明里面会提到吧。也有可能是仪器配套的软件。
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6楼2011-10-11 17:34:46
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nmrbiotech

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

premier biosoftware 吧。
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7楼2011-11-02 16:07:17
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果断悉尼
8楼2011-11-02 16:45:15
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blackbee
9楼2011-11-02 17:41:27
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xiayongxiu

金虫 (正式写手)
引用回帖:
298008楼: Originally posted by fanc232 at 2011-07-15 16:49:52
一片文献里使用到了ChIP reaction技术，就是把蛋白质和DNA复合物裂解成片段以后，用目的蛋白对应的抗体收集复合物片段，把里面的DNA分离纯化出来，PCR扩增，进一步检测等等，目的是确定目的蛋白结合在哪一种基因片段 ...

能否将参考文献列出？
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一切都要靠自己努力
10楼2012-06-14 19:28:11
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