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雪狼790

木虫 (正式写手)

[求助] linux新手请教一菜鸟问题

新的服务器,买来时已经装上的Suse

考了一份Gaussian09,在root目录下和sdb目录下各复制了一份

把一个在windows下GV中做的gif文件考到sdb下面的某个文件夹里

从gif文件所在的文件夹下打开Gmone终端,输入g09 1.gif,说command not found

输入g09 <1.gif> 1.out,说没有那个文件或目录

tail -20 1.gif,也说没有那个文件或目录,但我明明在文件夹里看到文件,并且能够双击打开修改保存的



请问各位大侠,我的错误出在哪儿呢?是不该重复考g09?是windows里的gif在这儿不能用?还是我的linux系统是本身可能少了啥啊?


拜谢各位大侠先。
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人生,郁闷是常态,我只是在每天力求变态而已
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吴大为

至尊木虫 (著名写手)

linux对后缀名不敏感,无需.exe后缀名,这就是说你在使用脚本时文件名要写全,比如“g09run.exe 1.gjf”;楼主的脚本文件和gjf文件放在了ziggy目录下,先cd到ziggy目录,那么使用此脚本时可以用“./g09run.exe ./1.gjf”“./”是指在当前目录下的意思;还有楼上提供的是C shell脚本,如果楼主用的不是C shell,则不能用。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
20楼2011-07-17 10:20:29
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查看全部 21 个回答

lxying

至尊木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
雪狼790(金币+10): 多谢指点 2011-07-14 10:40:45
小红豆(金币+3): 感谢交流 2011-07-14 18:38:03
设置一下bashrc文件,看看网上关于gaussian的安装说明。
明天会更好!
2楼2011-07-14 10:31:09
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雪狼790

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lxying at 2011-07-14 10:31:09:
设置一下bashrc文件,看看网上关于gaussian的安装说明。

我的那个gaussian, 我没有通过安装过程,是从别人那儿考来的文件夹

考给我的人说他当时安装那个,费了挺大劲儿的,后来他用这种考文件夹的方式考给别人几次都能运行

我那个tail不出文件来,我担心是我的系统本身有哪儿我疏乎了

以前基本没用过linux或unix,懂的太少了,唉,书到用时方恨少啊
人生,郁闷是常态,我只是在每天力求变态而已
3楼2011-07-14 10:44:05
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独孤狼

金虫 (正式写手)

独行者

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
gmy1990(金币+5): 呵呵 2011-07-14 11:31:40
给你个简单的脚本 根据自己的环境设置下变量,然后每次用脚本提交任务即可
#!/bin/csh
sed "/%c/ c\%chk=$1" $1 > tmp
mv -f tmp $1  
set workdir = $cwd
set scrdir  =  /scratch/$USER$1dir
set chfn = `/bin/grep -m 1 -i '%chk=' $1 | /bin/cut -c6-80`

rm -rf $scrdir
mkdir $scrdir
setenv g09root /g09的目录   
source $g09root/g09/bsd/g09.login
setenv GAUSS_SCRDIR $scrdir
setenv GAUSS_EXEDIR="$g09root/g09:$g09root/g09/private:$g09root/g09/bsd"
setenv GAUSS_SOFTTL 100000
setenv GAUSS_TIMEL 100000
cp $workdir/$1 $scrdir
cd $scrdir
mv $workdir/$chfn.chk.gz $scrdir
gunzip $chfn.chk.gz
$g09root/g09/g09 < $1 >& $scrdir/$1.out
/bin/cp $1.out $workdir
gzip $scrdir/$chfn.chk
mv  $chfn.chk.gz $workdir
/bin/rm -rf $scrdir
cd $workdir
$g09root/g09/bsd/clearipc
exit
轮回的过往,注定的未来;独孤的行者,孤独的路途……
4楼2011-07-14 10:44:21
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