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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Linux应用 » linux新手请教一菜鸟问题
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雪狼790

木虫 (正式写手)

[求助] linux新手请教一菜鸟问题

新的服务器，买来时已经装上的Suse

考了一份Gaussian09，在root目录下和sdb目录下各复制了一份

把一个在windows下GV中做的gif文件考到sdb下面的某个文件夹里

从gif文件所在的文件夹下打开Gmone终端，输入g09 1.gif，说command not found

输入g09 <1.gif> 1.out，说没有那个文件或目录

tail －20 1.gif，也说没有那个文件或目录，但我明明在文件夹里看到文件，并且能够双击打开修改保存的



请问各位大侠，我的错误出在哪儿呢？是不该重复考g09?是windows里的gif在这儿不能用？还是我的linux系统是本身可能少了啥啊？


拜谢各位大侠先。
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人生，郁闷是常态，我只是在每天力求变态而已
1楼 2011-07-14 10:27:51
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雪狼790

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by lxying at 2011-07-14 10:31:09:
设置一下bashrc文件，看看网上关于gaussian的安装说明。

我的那个gaussian， 我没有通过安装过程，是从别人那儿考来的文件夹

考给我的人说他当时安装那个，费了挺大劲儿的，后来他用这种考文件夹的方式考给别人几次都能运行

我那个tail不出文件来，我担心是我的系统本身有哪儿我疏乎了

以前基本没用过linux或unix，懂的太少了，唉，书到用时方恨少啊
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人生，郁闷是常态，我只是在每天力求变态而已
3楼2011-07-14 10:44:05
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雪狼790

木虫 (正式写手)
敢问2楼这位大侠，具体应该改动哪些啊，bashrc我这种菜鸟不敢轻易动啊
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5楼2011-07-14 10:46:38
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雪狼790

木虫 (正式写手)
哇，4楼的狼兄又一次出来救俺这只菜狼了
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6楼2011-07-14 10:51:39
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雪狼790

木虫 (正式写手)
这个“悬赏金币”，悬的是总数啊？俺还以为是每个回贴呢

又被鄙视了，唉
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7楼2011-07-14 10:55:18
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雪狼790

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-14 10:44:21:
给你个简单的脚本 根据自己的环境设置下变量，然后每次用脚本提交任务即可
#!/bin/csh
sed "/%c/ c\%chk=$1" $1 > tmp
mv -f tmp $1  
set workdir = $cwd
set scrdir  =  /scratch/$USER$1dir ...

是把这部分加到bashrc里么？
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9楼2011-07-14 16:59:14
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雪狼790

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-14 17:28:49:
不是，把他保存为一个文件，然后执行就可以了，其中
setenv g09root /g09的目录  
根据你的具体环境来设置

保存为.exe文件么

保存完了如何让它运行呢？

不好意思，俺是linux最初级菜鸟
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人生，郁闷是常态，我只是在每天力求变态而已
11楼2011-07-15 10:48:15
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雪狼790

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-15 12:14:36:
保存为任何一个文件，然后chmod 755 文件名
然后执行即可，linux下面的文件只要有执行权限就可以执行

俺先把狼兄给的那个脚本在windows下存为了g09run.txt， 其中将“/g09的目录”改写为"/home/ziggy/g09"

复制到服务器上之后，打开文件，另存为g09run.exe

然后输入chmod 755 g09run.exe

ls -l查看g09run.exe 的权限为-rwx-r-x-r-x

输入g09run 1.gif，显示“command not found"

请问狼兄，俺是哪步错了啊，是改目录的时候少写了一个"/"?还是最后的执行，应该用别的方式？

俺发现了，计算机这东东，就是欺负不懂的人啊
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13楼2011-07-15 13:02:28
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雪狼790

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by 独孤狼 at 2011-07-15 13:07:33:
在你g09run.exe的目录下面输入pwd 回车
将出来的目录复制下
然后执行  目录/g09run.exe 你的文件
或者将g09run 放到/bin下面 然后每次就像你那么用就可以了

我把g09run.exe复制到了bin中，回到/home/ziggy/g09run文件夹里，在终端中输入g09run 1.gif，还是显示command not found

我试了把g09run.exe和1.gif文件放在/home/ziggy下单独的文件夹g09run中，或把这两个文件都复制到/home/ziggy/g09文件夹中，结果显示的一样

在终端里提交可执行文件的作业，就是输入文件的名称吧？还是前面要有一个命令，比如cluster中的qsub？
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15楼2011-07-15 13:40:23
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雪狼790

木虫 (正式写手)
俺怎么就这么笨呢
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16楼2011-07-15 13:40:55
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