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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » DGGE图分析
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天鸟

木虫 (正式写手)

[交流] DGGE图分析 已有6人参与


在Ingen公司的仪器进行DGGE分析，跑胶条件为60度，变性剂浓度梯度为50%-70%，胶浓度为6%，DNA片段为500多bp。在90V，下跑了16.5h
大家帮忙提点意见，应该怎么改进图才好些，谢谢
感觉条带集中在一起，是应该缩小它的变性剂浓度范围吗？
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xiadongliang

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快乐生活，我快乐
1楼 2011-07-13 22:20:12
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biocontrol

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
scelab(金币+2): 谢谢交流 2011-07-15 13:38:00
过于集中，缩小胶的浓度或者加大电压
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裸奔进行时...
2楼2011-07-14 08:23:50
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xiadongliang

金虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
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总体来看，还是不错的。
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3楼2011-07-14 08:47:07
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天鸟

木虫 (正式写手)
谢谢，但是这块胶我都扔了，都没有切胶
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快乐生活，我快乐
4楼2011-07-14 09:02:57
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天鸟

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by biocontrol at 2011-07-14 08:23:50:
过于集中，缩小胶的浓度或者加大电压

你的意思是将6%的浓度再缩小的吗？请教
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快乐生活，我快乐
5楼2011-07-14 14:09:22
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yanhuifan

金虫 (小有名气)
★ ★ ★
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scelab(金币+2): 谢谢交流 2011-07-15 13:38:18
看着还不错咯，貌似点样量少了点，不太好切胶
另外，电压怎么这么低，我都200V跑，4h左右就行了
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6楼2011-07-14 15:50:18
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biocontrol

金虫 (小有名气)
★ ★
scelab(金币+2): 谢谢交流 2011-07-15 13:38:29
变性剂浓度梯度为50%-70%可以变成55-70啊，
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裸奔进行时...
7楼2011-07-14 16:42:38
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天鸟

木虫 (正式写手)
scelab: 你ps下，可以弄亮一点啊 2011-07-15 13:38:51
引用回帖:
Originally posted by biocontrol at 2011-07-14 16:42:38:
变性剂浓度梯度为50%-70%可以变成55-70啊，

[eimg]7f/0f/627037_1310648188_559.jpg[/eimg
这个是我第一次跑的图，当时的变性剂的浓度梯度为40%-70%，可惜胶破了
第一幅图感觉质量高些，就是图上面还是没有条带，将变性剂的梯度调整为55%-70%，会不会太窄了。不过我的上样产物还是有些不同，是同一模板在不同时间分别进行PCR的产物。可能上样产物也影响了我实验分析原因吧。
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快乐生活，我快乐
8楼2011-07-14 21:03:24
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天鸟

木虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by biocontrol at 2011-07-14 08:23:50:
过于集中，缩小胶的浓度或者加大电压

那都是师妹师兄多次DGGE的经验指导下，才出来的结果。还得谢谢他们呀
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快乐生活，我快乐
9楼2011-07-14 21:04:54
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biocontrol

金虫 (小有名气)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
scelab(金币+1): 谢谢交流 2011-07-15 13:39:03
其实，胶的下半部分都没有条带，所以我觉得梯度宽了点。跑的还是挺清楚地。
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裸奔进行时...
10楼2011-07-15 08:19:41
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