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88thunder

新虫 (正式写手)

天才流浪

[求助] TOPOS40画出拓朴结构了,但无法给出拓朴符号?

奇怪,我用TOPOS40画出了拓朴结构,但系统无法分析拓朴符号?请高手赐教!!
附件里有我的画的拓朴图
这是结果
#######################################
2:C42 H38 Cd3 N4 O14/clusters at ring>6
#######################################

Structure consists of molecules (ZD1). The composition of molecule is C6H6N
Structure consists of molecules (ZD2). The composition of molecule is C6H6N
Structure consists of molecules (ZE1). The composition of molecule is C6H4
Structure consists of molecules (ZE2). The composition of molecule is C6H4
Structure consists of molecules (ZE3). The composition of molecule is C6H4
Structure consists of molecules (ZF1). The composition of molecule is C12H14N2O14Cd3
Structure consists of molecules (ZF2). The composition of molecule is C12H14N2O14Cd3
Topology for ZD1
--------------------
Atom ZD1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)        f Total SA
ZD 2    0.2893    0.3097    0.5541   ( 0 0 0)     3.950A        1  58.98
ZF 1    0.0000    0.3360    0.2500   ( 0 0 0)     7.321A        1  41.02
Topology for ZD2
--------------------
Atom ZD2 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)        f Total SA
ZD 1    0.1641    0.3296    0.4502   ( 0 0 0)     3.950A        1  58.49
ZF 2    0.5000    0.4015    0.7500   ( 1 1 1)     7.371A        1  41.51
Topology for ZE1
--------------------
Atom ZE1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)        f Total SA
ZF 1    1.0000    0.3360    0.2500   ( 1 0 0)     5.926A        1  49.88
ZF 2    0.5000   -0.4015    0.2500   ( 0-1 0)     6.515A        1  50.12
Topology for ZE2
--------------------
Atom ZE2 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)        f Total SA
ZF 1    0.0000    0.3360    0.2500   ( 0 0 0)     4.590A        1  49.68
ZF 2    0.5000    0.5985    0.2500   ( 0 0 0)     4.676A        1  50.32
Topology for ZE3
--------------------
Atom ZE3 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)        f Total SA
ZF 2    0.5000    0.5985    0.2500   ( 0 0 0)     5.927A        1  50.02
ZF 1    0.0000    1.3360    0.2500   ( 0 1 0)     6.569A        1  49.98
Topology for ZF1
--------------------
Atom ZF1 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)        f Total SA
ZE 2    0.2479    0.4626    0.2496   ( 0 0 0)     4.590A        1  14.19
ZE 2   -0.2479    0.4626    0.2504   ( 0 0 0)     4.590A        1  14.19
ZE 1   -0.2291    0.0695    0.3167   (-1 0 0)     5.926A        1  14.17
ZE 1    0.2291    0.0695    0.1833   ( 1 0 0)     5.926A        1  14.17
ZE 3    0.2770   -0.1294    0.3194   ( 0-1 0)     6.569A        1  14.25
ZE 3   -0.2770   -0.1294    0.1806   ( 0-1 0)     6.569A        1  14.25
ZD 1    0.1641    0.3296    0.4502   ( 0 0 0)     7.321A        1   7.39
ZD 1   -0.1641    0.3296    0.0498   ( 0 0 0)     7.321A        1   7.39
Topology for ZF2
--------------------
Atom ZF2 links by bridge ligands and has
Common vertex with                                R(A-A)        f Total SA
ZE 2    0.7521    0.4626    0.2504   ( 1 0 0)     4.676A        1  14.21
ZE 2    0.2479    0.4626    0.2496   ( 0 0 0)     4.676A        1  14.21
ZE 3    0.2770    0.8706    0.3194   ( 0 0 0)     5.927A        1  13.80
ZE 3    0.7230    0.8706    0.1806   ( 1 0 0)     5.927A        1  13.80
ZE 1    0.7709    1.0695    0.3167   ( 0 1 0)     6.515A        1  14.56
ZE 1    0.2291    1.0695    0.1833   ( 1 1 0)     6.515A        1  14.56
ZD 2    0.7107    0.6903    0.4459   ( 1 1 1)     7.371A        1   7.43
ZD 2    0.2893    0.6903    0.0541   ( 0 1-1)     7.371A        1   7.43
-------------------------
Structural group analysis
-------------------------

-------------------------
Structural group No 1
-------------------------
Structure consists of 3D framework with ZFZE3ZD2
Elapsed time: 2.45 sec.
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天才在流浪,流浪是天涯。
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铁血丹心志

木虫 (著名写手)

请问你是如何简化结构的用TOPOS4.0,我的那个软件也有问题 ,先请教下简化结构,谢谢。
加油!!!
7楼2015-08-03 23:58:12
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查看全部 8 个回答

xingchenbeihai

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

88thunder(金币+2): 2011-07-13 15:09:16
你的设置有问题,我也出现过这种情况
操千曲而后晓声,观千剑而后识器
2楼2011-07-13 10:42:11
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xingchenbeihai

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

88thunder(金币+2): 2011-07-13 15:09:13
也不对啊,你这里什么都出来,就是拓扑信息没出来,跟我遇到的问题好像也不一样,不懂
操千曲而后晓声,观千剑而后识器
3楼2011-07-13 10:48:00
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88thunder

新虫 (正式写手)

天才流浪

引用回帖:
Originally posted by xingchenbeihai at 2011-07-13 10:42:11:
你的设置有问题,我也出现过这种情况

能不能具体点,你认为是哪里出了问题,我可以把我简化的数据让你看看,请指教??
天才在流浪,流浪是天涯。
4楼2011-07-13 15:10:07
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