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aimonkey金虫 (正式写手)
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[求助]
如何解析优化不到的中间体
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| 情况是这样的:作者提出的可能的路径中，有一个中间体我优化不到，现在认为那个中间体并不是作者提出的路径中的一个稳定的中间体，现在的问题是如何对这个情况进行解析，有没有文献也提到过类似的情况，别人是怎样解析的，如果有这样的文献，请告知。自己也在查找中，谢谢虫友相助 |
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【答案】应助回帖
★ ★ ★
aimonkey(金币+5): thank you 2011-07-12 20:22:21
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-12 21:14:42
aimonkey(金币+5): thank you 2011-07-12 20:22:21
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-12 21:14:42
| 作者提出的机理不一定是正确的，验证的话方法有很多。如果你找到前面后者后面的过渡态了那调一下构象然后优化下看看优化后的构象是怎样的，或者做irc分析。如果前后两个构象的差别不是很大scan也是可以接受的，看一下随着主要变化的键长键角二面角的变化体系的能量的变化。当然这是一些简单验证的方法，还有一种可能性是因为你方法本身的局限性，由于对一些弱相互作用考虑的不多而导致找不到那个稳定的中间体构象。对此最好仔细分析下你的体系然后决定该用哪一种方法，不要盲目的乱试…… |
2楼2011-07-12 18:25:02
aimonkey
金虫 (正式写手)
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3楼2011-07-12 20:45:29