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vigaryang木虫 (正式写手)
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如何利用刚性扫描改变复合物的构型
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| 在研究两个分子A和B的相互作用时，需要先得到由这两个分子形成的复合物的最优构型。在通常情况下，我会通过将分子A放在分子B四周不同位置得到多个初始构型，再分别进行高斯计算得到。然而，由于这次要计算的两个分子都比较大，难以做到对大量的初始构型进行优化计算，因此打算利用刚性扫描筛选出一到数个较为合适的初始构型。在扫描中，需要改变分子A作为一个整体相对于分子B的位置。但是，我在查阅高斯指南对scan关键词的介绍时，发现只给出了扫描键长、二面角等局域几何参数的例子，而没有给出扫描某个片段整体位移的方法。因此，想请教各位，对于我这种情况，scan的输入文件应当怎样编辑？谢谢！ |
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9楼2011-07-13 18:00:42
2楼2011-07-10 01:35:59
游子8921
铁杆木虫 (知名作家)
游子8921
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