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04nylxb

木虫 (正式写手)

[求助] 求VASP4.6的编译文件_基于ifort编译器和atlas数学库

这两天准备安装vasp4.6,操作系统是centos5.4 (64 bit),四核,编译器用的是intel的ifort9.1.036,数学库mkl9.1.023一直安装不上,安装的时候提示rpm的问题,mkl装不上。于是就下了atlas (atlas 3.6.0_Linux_P4SSE2)。
vasp.4.lib下编译成功(用的是makefile.linux_ifc_P4)。但是编译vasp.4.6的时候,就遇到麻烦了,cp makefile.linux_ifc_P4 makefile 之后,这个makefile文件如何修改呢?如何将数学库修改成atlas?
网上给的方案都是ifort+mkl或者是pgi+atlas,我就不知道怎么改了,请问有高人用过ifort+atlas编译vasp4.6吗?能否给个makefile文件?非常感谢。
我邮箱是04nylxb@zju.edu.cn

是否centos5.4 装不了mkl?安装的时候总是提示
Unable to find rpm tool, please add its location to your PATH and restart installation mkl
我已经切换到root账户了。
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lzllzl

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-07-08 16:22:25
04nylxb(金币+2): 多谢啊,可是我安装rpm的软件的时候一切正常啊,呵呵。 2011-07-08 22:04:16
好像你的系统没有安装rpm吧?安装rpm工具就行了。
2楼2011-07-08 15:32:01
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04nylxb

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by lzllzl at 2011-07-08 15:32:01:
好像你的系统没有安装rpm吧?安装rpm工具就行了。

应该是装了的,呵呵
rpm-build-4.4.2.3-18.el5
rpm-4.4.2.3-18.el5
rpm-python-4.4.2.3-18.el5
rpm-devel-4.4.2.3-18.el5
rpm-devel-4.4.2.3-18.el5
redhat-rpm-config-8.0.45-32.el5.centos
rpm-libs-4.4.2.3-18.el5
rpm-libs-4.4.2.3-18.el5
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3楼2011-07-08 22:04:55
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04nylxb

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 04nylxb at 2011-07-08 14:05:46:
这两天准备安装vasp4.6,操作系统是centos5.4 (64 bit),四核,编译器用的是intel的ifort9.1.036,数学库mkl9.1.023一直安装不上,安装的时候提示rpm的问题,mkl装不上。于是就下了atlas (atlas 3.6.0_Linux_P4S ...

对了,我的atlas数学库解压后是在
/home/lxb/softwar/Linux_P4SSE2

intel的编译器ifort是安装在
/opt/intel/fce/9.1.036/bin
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4楼2011-07-08 22:16:23
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jq120

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


uuv2010(金币+1): 多谢提示 2011-07-09 15:37:46
04nylxb(金币+3): 多谢,呵呵 2011-07-11 20:21:14
intel可以去申请最新的,这个是免费的。
vasp安装可以参考这个文章,地址是http://spinor.ycool.com/post.3355647.html

编译 vasp.4.6, ────> 进入源码目录,根据CPU和编译器选择makefile文件,并修改编译命令
user@~$ cd /tmp/vasp.4.6/
user@/tmp/vasp.4.6$ vim makefile.linux_ifc_ath
# 50行 FC=ifc , 改为 FC=ifort


# 修改atlas数学库的路径
# 102行 改为 ATLASHOME= /opt/Linux_ATHLON/lib

# 把330行之后的参数 ‘-e95′ 全部删除,然后编译
user@/tmp/vasp.4.lib$ make -f makefile.linux_ifc_ath

不删除参数 ‘-e95′ 会出现ERROR: “The computed GOTO statement is an obsolescent feature in Fortran 95.” ;
GOTO似乎是 Fortran 95 废弃的语法,5.0版应该会改正;
“-e95″ 参数会把F95编译F77程式码产生的警告(warning)改成错误(error)型式输出,造成编译强迫停止无法忽略跳过!
5楼2011-07-09 13:33:14
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xianxianlu

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-07-10 08:22:35
04nylxb(金币+3): 这个我下了,我centos5.4,但是运行不起来啊。有无说明文档?多谢,呵呵。 2011-07-11 20:22:27
04nylxb(金币+5): 非常感谢 2011-08-03 08:55:17
VASP5.2并行可执行程序包,Redhat企业版Linux5.0以上。
http://ishare.iask.sina.com.cn/f/16892492.html

不用自己编译了!
量子化学与计算化学
6楼2011-07-10 06:55:47
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04nylxb

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by xianxianlu at 2011-07-10 06:55:47:
VASP5.2并行可执行程序包,Redhat企业版Linux5.0以上。
http://ishare.iask.sina.com.cn/f/16892492.html

不用自己编译了!

嗯,下载了这个,但是不知道该如何用啊?还要装上数学库和编译器吗?
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7楼2011-07-11 20:23:33
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jq120

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 04nylxb at 2011-07-11 20:23:33:
嗯,下载了这个,但是不知道该如何用啊?还要装上数学库和编译器吗?

这个似乎是红帽子企业版上的。
楼上安装的是企业版吗?
8楼2011-07-11 20:34:36
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souledge

专家顾问 (著名写手)

★ ★
zzy870720z(金币+2): 鼓励交流 2011-07-13 09:24:56
我是用的ifort+部分自定义的库,LAPACK使用的是自带的,BLAS使用的是PWscf带的……fftw3使用的是从www.fftw3.org下载的~
使用的两个系统是CentOS 5.6和Scientific Linux 6.0,都是用的ifort 2011,编译VASP 4.6没有问题的~
思想重于技巧,内涵重于表象
9楼2011-07-12 18:15:00
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04nylxb

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by souledge at 2011-07-12 18:15:00:
我是用的ifort+部分自定义的库,LAPACK使用的是自带的,BLAS使用的是PWscf带的……fftw3使用的是从www.fftw3.org下载的~
使用的两个系统是CentOS 5.6和Scientific Linux 6.0,都是用的ifort 2011,编 ...

嗯,多谢,呵呵,我得花点时间看看编译方面的东西。
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10楼2011-07-14 09:22:40
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