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xxjnl

金虫 (小有名气)

[求助] 请问关于PLATON使用的问题?

看到文献中有The unligated water molecules in 1 occupy 14.2% of the unit cell volume, according to a PLATON calculation.请问该值是如何通过PLATON得到,请说的详细点,谢谢!
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chilajiao

金虫 (知名作家)

深海家族No.1

优秀版主

来学习

建议把标题写详细点
只爱乐儿
2楼2011-07-04 21:28:47
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zhaoyangqufu

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

drg1984: 这个不算应助! 2011-07-05 13:32:49
unligated是什么意思啊楼主?
3楼2011-07-05 09:46:04
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caoyuannust

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
drg1984(金币+1): 感谢应助! 2011-07-05 13:32:57
PLATON里面有个子程序就是计算溶剂占有体积(solvent accessible volume)的,选start---graphical menu 弹出界面中选calc solv就ok了
4楼2011-07-05 10:29:41
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xxjnl

金虫 (小有名气)

unligated是没有参与配位的游离水分子了,还是不对呀!
5楼2011-07-05 11:19:40
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52070606031

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
drg1984(金币+1): 感谢应助! 2011-07-05 13:33:05
xxjnl(金币+5): 2011-07-06 06:19:28
在ins文件里killd掉溶剂水分子,save一下,xl精修一下,在platon里导入新生成的cif文件。。。点击solv。结果就出来了。。。
天道酬勤
6楼2011-07-05 12:54:30
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尚云凤

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
drg1984(金币+1): 感谢交流! 2011-07-07 09:38:00
xp中,kill $Q,,save,xl;  WinGX中,Analyse,platon,solv即可
人生没有彩排,每时每刻都是现场直播!
7楼2011-07-05 15:31:19
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shmily326

木虫 (正式写手)


★
drg1984(金币+1): 感谢交流! 2011-07-07 09:38:08
在cif中把溶剂水分子删除保存,然后用三楼的方法就可以计算出来了,用三楼的方法会产生一个文件,你在文件中可以找到需要的数值
8楼2011-07-06 20:27:21
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