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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 求助：gaussian计算出错。
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rulongxu

至尊木虫 (小有名气)

[求助] 求助：gaussian计算出错。

在用G03 PCM计算溶剂化效应时，报告有连成双键的H原子，计算以出错退出。请高手指教。 非常感谢！
现把出错信息附上,请各位帮忙：
United Atom Topological Model (UA0  parameters set).
UA0: Hydrogen  68 has two bounds. Keep it explicit at all point on the
UA0: potential energy surface to get meaningful results.

input file 如下:  
# m052x/6-31+g scrf=(pcm,solvent=8) scf=tight

0 1
C                 -2.32850000   -1.07790000   -2.68390000
C                 -2.32850000    0.26190000   -2.68390000
C                 -1.06410000    0.99190000   -2.68390000
C                  0.09630000    0.32190000   -2.68390000
C                  0.09630000   -1.13790000   -2.68390000
C                 -1.06410000   -1.80790000   -2.68390000
C                 -1.06410000   -3.32790000   -2.68390000
C                 -0.33810000   -3.84130000   -3.94130000
C                 -0.33810000   -3.84130000   -1.42650000
C                 -1.06410000   -3.32790000   -0.16900000
C                 -1.06400000   -1.80790000   -0.16900000
C                 -2.51600000   -3.84130000   -0.16900000
C                 -2.51600000   -5.38130000   -0.16900000
C                 -1.79950000   -5.88800000    1.07190000
C                 -3.96800000   -5.89460000   -0.16900000
C                 -1.64420000   -1.13800000    0.83580000
C                 -1.64420000    0.32200000    0.83580000
C                 -1.06400000    0.99190000   -0.16910000
C                 -0.43180000    0.26200000   -1.26400000
C                 -0.43180000   -1.07790000   -1.26400000
C                 -1.67710000   -7.20530000    1.28390000
C                 -0.98880000   -7.69200000    2.47600000
C                 -0.47950000   -6.82130000    3.35810000
C                 -0.61290000   -5.38590000    3.12710000
C                 -1.24460000   -4.93920000    2.03300000
C                 -1.06400000    2.51190000   -0.16910000
C                 -2.51590000    3.02530000   -0.16910000
C                 -0.33800000    3.02530000    1.08820000
C                  1.11380000    2.51190000    1.08830000
C                  1.83980000    3.02520000    2.34570000
C                 -3.24190000    2.51200000    1.08820000
C                 -4.69380000    3.02530000    1.08820000
C                 -2.52530000    3.01860000    2.32930000
C                  1.83040000    3.01860000   -0.15270000
C                 -2.98310000    2.69490000    3.54630000
C                 -2.29490000    3.18150000    4.73840000
C                 -1.20540000    3.95190000    4.61550000
C                 -0.70660000    4.30460000    3.28950000
C                 -1.33820000    3.85800000    2.19540000
C                  3.11320000    2.69480000   -0.36480000
C                  3.80150000    3.18150000   -1.55690000
C                  3.15030000    3.95190000   -2.43890000
C                  1.75260000    4.30460000   -2.20790000
C                  1.12090000    3.85790000   -1.11380000
C                  3.86690000    4.45850000   -3.68000000
C                  4.35080000    3.26070000   -4.51830000
C                  2.89890000    5.31410000   -4.51830000
C                  5.07680000    3.77400000   -5.77570000
C                  5.56080000    2.57630000   -6.61390000
C                  4.10890000    4.62960000   -6.61390000
C                  4.83480000    5.14290000   -7.87130000
C                  3.86690000    5.99850000   -8.70960000
C                  6.04480000    5.99850000   -7.45220000
S                 -1.06410000    2.78190000   -2.68390000
O                 -1.88900000    3.36530000   -1.25500000
O                  0.58570000    3.36520000   -2.68390000
O                 -1.88900000    3.36520000   -4.11270000
S                  0.36420000   -7.41800000    4.81960000
O                  1.73910000   -8.39020000    4.34330000
O                  0.91420000   -6.05690000    5.77220000
O                 -0.73560000   -8.39020000    5.77220000
S                 -0.36160000    4.54850000    6.07700000
O                  0.18830000    3.18740000    7.02960000
O                  1.01330000    5.52070000    5.60080000
O                 -1.46150000    5.52080000    7.02960000
H                 -3.26380000   -1.61790000   -2.68390000
H                 -3.26380000    0.80190000   -2.68390000
H                  1.03160000    0.86190000   -2.68390000
H                  1.03160000   -1.67800000   -2.68390000
H                 -2.09170000   -3.69130000   -2.68390000
H                 -0.33810000   -4.93130000   -3.94130000
H                 -0.85200000   -3.47790000   -4.83120000
H                  0.68940000   -3.47790000   -3.94130000
H                 -0.33810000   -4.93130000   -1.42650000
H                  0.68940000   -3.47790000   -1.42650000
H                 -0.55020000   -3.69130000    0.72080000
H                 -3.02980000   -3.47790000    0.72090000
H                 -3.02980000   -3.47790000   -1.05900000
H                 -2.00220000   -5.74460000   -1.05900000
H                 -3.96800000   -6.98460000   -0.16900000
H                 -4.48180000   -5.53120000    0.72090000
H                 -4.48180000   -5.53120000   -1.05900000
H                 -2.11190000   -1.67800000    1.64580000
H                 -2.11190000    0.86200000    1.64580000
H                  0.03570000    0.80190000   -2.07410000
H                  0.03570000   -1.61800000   -2.07400000
H                 -2.08750000   -7.90710000    0.57300000
H                 -0.89010000   -8.75390000    2.64690000
H                 -0.20240000   -4.68410000    3.83800000
H                 -1.34320000   -3.87740000    1.86210000
H                 -0.55010000    2.87530000   -1.05900000
H                 -2.51590000    4.11530000   -0.16910000
H                 -3.02970000    2.66200000   -1.05910000
H                 -0.33800000    4.11530000    1.08820000
H                 -0.85180000    2.66190000    1.97820000
H                  1.11380000    1.42190000    1.08830000
H                  2.86750000    2.66190000    2.34570000
H                  1.83980000    4.11520000    2.34560000
H                  1.32600000    2.66190000    3.23560000
H                 -3.24190000    1.42200000    1.08820000
H                 -5.20760000    2.66200000    1.97820000
H                 -4.69370000    4.11530000    1.08820000
H                 -5.20760000    2.66200000    0.19820000
H                 -3.86120000    2.07400000    3.64540000
H                 -2.66390000    2.92060000    5.71930000
H                  0.17150000    4.92550000    3.19040000
H                 -0.96930000    4.11890000    1.21450000
H                  3.63810000    2.07390000    0.34610000
H                  4.83550000    2.92050000   -1.72780000
H                  1.22770000    4.92550000   -2.91880000
H                  0.08690000    4.11890000   -0.94290000
H                  4.72320000    5.06410000   -3.38330000
H                  5.03590000    2.65520000   -3.92490000
H                  3.49440000    2.65520000   -4.81490000
H                  3.41280000    5.67740000   -5.40830000
H                  2.04250000    4.70850000   -4.81490000
H                  2.55640000    6.16190000   -3.92500000
H                  5.93320000    4.37960000   -5.47900000
H                  6.07460000    2.93960000   -7.50390000
H                  6.24590000    1.97070000   -6.02060000
H                  4.70440000    1.97070000   -6.91060000
H                  3.25250000    4.02400000   -6.91060000
H                  3.76630000    5.47740000   -6.02060000
H                  5.17740000    4.29510000   -8.46460000
H                  4.38070000    6.36180000   -9.59960000
H                  3.01050000    5.39290000   -9.00630000
H                  3.52430000    6.84620000   -8.11630000
H                  6.55860000    6.36180000   -8.34220000
H                  5.70220000    6.84630000   -6.85890000
H                  6.72990000    5.39290000   -6.85880000
H                 -1.88900000    4.32520000   -4.11270000
H                 -0.28310000   -8.71020000    6.55600000
H                 -1.00890000    5.84080000    7.81350000
C                  0.78190000    4.97010000   10.27150000
C                  0.62570000    3.80550000   11.26690000
C                  0.51150000    2.47970000   10.49180000
C                 -0.63040000    4.01770000   12.12400000
C                  1.84050000    3.75690000   12.20810000
C                 -0.87370000    2.73510000   12.93610000
C                  1.61370000    2.75030000   13.32780000
C                  2.82070000    2.20440000   14.07330000
C                  0.38890000    2.32420000   13.68360000
C                  2.05900000    5.13440000   12.81220000
C                  1.24290000    6.14590000   12.48670000
C                  1.45280000    7.46910000   13.06690000
O                  0.70970000    8.39010000   12.77070000
C                  2.59730000    7.69910000   14.04040000
H                 -0.08770000    5.00650000    9.61550000
H                  0.86270000    5.90850000   10.82020000
H                  1.68140000    4.81970000    9.67450000
H                  1.41100000    2.32930000    9.89480000
H                  0.40100000    1.65540000   11.19630000
H                 -0.35800000    2.51610000    9.83570000
H                 -1.48800000    4.21720000   11.48140000
H                 -0.47860000    4.85980000   12.79910000
H                  2.72310000    3.46580000   11.63860000
H                 -1.16510000    1.93270000   12.25830000
H                 -1.67370000    2.91180000   13.65520000
H                  3.35860000    3.02670000   14.54530000
H                  2.48860000    1.50140000   14.83710000
H                  3.48050000    1.69380000   13.37180000
H                  0.29620000    1.66470000   14.53370000
H                  2.87230000    5.29790000   13.50380000
H                  0.42960000    5.98240000   11.79510000
H                  2.59480000    8.73980000   14.36470000
H                  2.47440000    7.04850000   14.90610000
H                  3.54350000    7.47430000   13.54830000

1 2 2.0 6 1.0 66 1.0
2 3 1.0 67 1.0
3 4 2.0 54 1.0
4 5 1.0 68 1.0
5 6 2.0 69 1.0
6 7 1.0
7 8 1.0 9 1.0 70 1.0
8 71 1.0 72 1.0 73 1.0
9 10 1.0 74 1.0 75 1.0
10 11 1.0 12 1.0 76 1.0
11 16 2.0 20 1.0
12 13 1.0 77 1.0 78 1.0
13 14 1.0 15 1.0 79 1.0
14 21 2.0 25 1.0
15 80 1.0 81 1.0 82 1.0
16 17 1.0 83 1.0
17 18 2.0 84 1.0
18 19 1.0 26 1.0
19 20 2.0 85 1.0
20 86 1.0
21 22 1.0 87 1.0
22 23 2.0 88 1.0
23 24 1.0 58 1.0
24 25 2.0 89 1.0
25 90 1.0
26 27 1.0 28 1.0 91 1.0
27 31 1.0 92 1.0 93 1.0
28 29 1.0 94 1.0 95 1.0
29 30 1.0 34 1.0 96 1.0
30 97 1.0 98 1.0 99 1.0
31 32 1.0 33 1.0 100 1.0
32 101 1.0 102 1.0 103 1.0
33 35 2.0 39 1.0
34 40 2.0 44 1.0
35 36 1.0 104 1.0
36 37 2.0 105 1.0
37 38 1.0 62 1.0
38 39 2.0 106 1.0
39 107 1.0
40 41 1.0 108 1.0
41 42 2.0 109 1.0
42 43 1.0 45 1.0
43 44 2.0 110 1.0
44 111 1.0
45 46 1.0 47 1.0 112 1.0
46 48 1.0 113 1.0 114 1.0
47 115 1.0 116 1.0 117 1.0
48 49 1.0 50 1.0 118 1.0
49 119 1.0 120 1.0 121 1.0
50 51 1.0 122 1.0 123 1.0
51 52 1.0 53 1.0 124 1.0
52 125 1.0 126 1.0 127 1.0
53 128 1.0 129 1.0 130 1.0
54 55 2.0 56 2.0 57 1.0
55
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58 59 2.0 60 2.0 61 1.0
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61 132 1.0
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135 136 1.0 137 1.0 138 1.0
136 151 1.0 152 1.0 153 1.0
137 139 1.0 154 1.0 155 1.0
138 140 1.0 143 1.0 156 1.0
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140 141 1.0 142 2.0
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1楼 2011-07-04 07:49:13
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rulongxu

至尊木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhangmt at 2011-07-04 08:24:44:
一个有意义的计算，源自于一个有意义的分子结构。
1、你这个初始结构，不是来自于一个学化学的人画出来的，大量的原子交叉重叠，这种结构是根本不存在的——两个原子都撞倒一起了，怎么可能呢？已经不仅仅是H成双 ...

非常感谢你的回复。我目前才刚开始学习gaussian软件，完全是新手。我会根据你的回复好好修改的。希望以后能够多多指导。
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4楼2011-07-04 10:07:52
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查看全部 4 个回答

tjuZidan

木虫 (小有名气)
geom=connectivity
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别以后想起又是遗憾
2楼2011-07-04 08:24:18
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zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-04 08:55:13
rulongxu(金币+5): 非常感谢。 2011-07-04 10:06:14
一个有意义的计算，源自于一个有意义的分子结构。
1、你这个初始结构，不是来自于一个学化学的人画出来的，大量的原子交叉重叠，这种结构是根本不存在的——两个原子都撞倒一起了，怎么可能呢？已经不仅仅是H成双键的问题了。
2、结构还没优化，就做溶剂单点算，没有丝毫意义。
3、没有geom=connectivity, 却有链接关系表，奇怪的写法。
4、这么多原子，还用上6-31+g的基组，你用什么机器来算呢？是世界top10么？
5、为什么用弥散基组呢？哪个文献提示你要加弥散呢？

找个做计算化学的人帮你做吧。。这个东东，目前来看，你做不来的。
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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以
3楼2011-07-04 08:24:44
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