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饭饭316

新虫 (小有名气)

[求助] 求助chem3D溶质与溶剂对接问题

各位大虾,我因为要做溶剂效应的量化计算,因此要对溶质和溶剂进行对接处理,可是我不会,想请教各位大虾下,怎么用chem3D进行对接呢?
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫


★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-07-02 21:01:57
Chem3D的dock是基于几何限制进行的,令原子对儿之间的距离尽可能满足期望的距离。先在一个窗口内弄出两个或多个分子,然后将要dock的两个分子中相对应的原子对儿选上,点右键-display distance measurement,然后将optimal写上dock之后的预期数值。反复如此至少设定三对儿。之后view-dock即可。
由于这种对接很糙,有必要再进行优化。
2楼2011-07-02 20:49:16
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