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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » ChemOffice » 求助chem3D溶质与溶剂对接问题
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饭饭316

新虫 (小有名气)

[求助] 求助chem3D溶质与溶剂对接问题

各位大虾，我因为要做溶剂效应的量化计算，因此要对溶质和溶剂进行对接处理，可是我不会，想请教各位大虾下，怎么用chem3D进行对接呢？
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1楼 2011-07-01 21:16:43
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sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫
★ ★ ★
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-07-02 21:01:57
Chem3D的dock是基于几何限制进行的，令原子对儿之间的距离尽可能满足期望的距离。先在一个窗口内弄出两个或多个分子，然后将要dock的两个分子中相对应的原子对儿选上，点右键-display distance measurement，然后将optimal写上dock之后的预期数值。反复如此至少设定三对儿。之后view-dock即可。
由于这种对接很糙，有必要再进行优化。
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2楼2011-07-02 20:49:16
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