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bingdieduwu

金虫 (正式写手)

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[求助] 紧急求助，谁能帮我优化一个分子，关于氢键的

因为要考虑氢键的作用，需要用MP2/aug-cc-pvdz or aug-cc-pvtz,分子比较大，60多个原子，因为涉及到毕业需要的一篇文章，请大家帮忙，不胜感激

如果因为分子太大实现不了MP2，能用其他基组代替吗，用啥基组来算审稿人能够接受呢？请大家指点

[ Last edited by bingdieduwu on 2011-6-28 at 09:56 ]

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bingdieduwu

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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!

1楼 2011-06-27 16:01:45

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beefly

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地沟油冶炼专家

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性别: GG
专业: 理论和计算化学
管辖: 计算模拟

MP2可能会高估氢键的相互作用，SCS－MP2更可靠一些。如果结合密度拟合基或类似的技术，计算60原子体系不会有问题。而且，这种方法有解析梯度。缺点是目前还没有解析频率，因此计算数值频率大概要算几百个单点的梯度。如果你能用几十个或更多的节点，建议用molpro的mppx模式（似乎需要买源代码，自己编译），最多一个月就能算完。

还可以结合一些近似，把不影响氢键的大取代基替换为小取代基。