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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 紧急求助，谁能帮我优化一个分子，关于氢键的
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)

[求助] 紧急求助，谁能帮我优化一个分子，关于氢键的

因为要考虑氢键的作用，需要用MP2/aug-cc-pvdz or aug-cc-pvtz,分子比较大，60多个原子，因为涉及到毕业需要的一篇文章，请大家帮忙，不胜感激

如果因为分子太大实现不了MP2，能用其他基组代替吗，用啥基组来算审稿人能够接受呢？请大家指点

[ Last edited by bingdieduwu on 2011-6-28 at 09:56 ]
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bingdieduwu bingdieduwu

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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
1楼2011-06-27 16:01:45
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beefly

专家顾问 (职业作家)

地沟油冶炼专家
MP2可能会高估氢键的相互作用，SCS－MP2更可靠一些。如果结合密度拟合基或类似的技术，计算60原子体系不会有问题。而且，这种方法有解析梯度。缺点是目前还没有解析频率，因此计算数值频率大概要算几百个单点的梯度。如果你能用几十个或更多的节点，建议用molpro的mppx模式（似乎需要买源代码，自己编译），最多一个月就能算完。

还可以结合一些近似，把不影响氢键的大取代基替换为小取代基。
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beefly《西太平洋大学现代英汉词典》[bi:fli]牛肉一般地
12楼2011-06-28 21:44:32
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)
引用回帖:
Originally posted by bingdieduwu at 2011-06-27 16:01:45:
因为要考虑氢键的作用，需要用MP2/aug-cc-pvdz or aug-cc-pvtz,分子比较大，60多个原子，因为涉及到毕业需要的一篇文章，请大家帮忙，不胜感激
...

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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
2楼2011-06-28 09:57:43
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奔鲨

铁虫 (著名写手)
★
zhou2009(金币+1): 2011-06-28 11:28:30
有些高校比如贵州大学有个什么超级计算中心，也许不收费，你可以联系一下
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bingdieduwu
to realize something, never complain too much about the effort, you have no right to say you don't like.
3楼2011-06-28 10:31:43
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bingdieduwu

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
Originally posted by 奔鲨 at 2011-06-28 10:31:43:
有些高校比如贵州大学有个什么超级计算中心，也许不收费，你可以联系一下

好，非常感谢您，O(∩_∩)O谢谢
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我以微薄的力量，寻找属于自己的天堂!
4楼2011-06-28 10:40:44
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