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kathy2008

木虫 (正式写手)

[求助] 如何从高斯输出文件快速提出 pai 轨道信息。

如题。从高斯输出文件提出了eigenvector那一部分出来,即附件1。现在需要得到 pai 轨道信息。即附件2。 附件2 对应于附件1的32号,35号,38号,39号,40号,41号轨道(占据轨道),42号一直到47号(非占据轨道)的2Px值。求一小程序。请指点。谢谢。
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kathy2008

木虫 (正式写手)


dubo(金币+1): 欢迎常来程序语言版讨论 2011-07-31 13:36:56
引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2011-07-03 22:28:17:
你的 .out 文件是咋生成的,这次的这个文件比上次的文件每一行前面多了一个空格……

所以,你把程序中:
CODE:
line = line(21:)

改成
CODE:
line = line(22:)

就可以了……

运行后报错信息如下:
*** glibc detected *** ./a.out: double free or corruption (out): 0x00000000079e2980 ***
======= Backtrace: =========
/lib64/libc.so.6[0x3e64871ce2]
/lib64/libc.so.6(cfree+0x8c)[0x3e6487590c]
./a.out[0x4012c5]
./a.out[0x4019de]
/lib64/libc.so.6(__libc_start_main+0xf4)[0x3e6481d974]
./a.out[0x400a99]
6楼2011-07-04 07:23:29
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★
ben_ladeng(金币+2): 很详细,待楼主评定后奖励程序强帖 2011-06-18 17:42:21
kathy2008(金币+10): 2011-06-19 13:00:43
微尘、梦想(程序强帖+1): 2011-06-19 17:04:28
大概这个样子。只是需要手工输入轨道号(这样可能灵活一些),每次输入一个轨道序号,回车,输入 0 则结束整个程序……
CODE:
program ei
real, dimension(:,:), allocatable :: px,ppx
character(len=256) :: line
character(len=40) :: fm
integer :: nrow, ncol, i, j, k, ios

open(unit=12, file='eigenvector.out', status='old')
open(unit=13, file='2px.out', status='new')

do
   read(12,'(a)', iostat=ios) line
   if (ios /= 0) exit
   if (index(line,'EIGENVALUES') /= 0) then
      nrow=0
      ncol=0
      do
         read(12,'(a)', iostat=ios) line
         if (ios /= 0) exit
         if (line(1:4) == '    ') exit
         ncol=ncol+1
         if (index(line, '2PX') /= 0) nrow=nrow+1
      end do
      exit
   end if
end do

!write (*,*) nrow, ncol
rewind (12)

allocate(px(nrow,ncol),ppx(nrow,ncol))

i=0
j=0
do
   read(12,'(a)', iostat=ios) line
   if (ios /= 0) exit
   if (i == nrow) then
       i=0
       j=j+n
   end if
   if (index(line, '2PX') /= 0) then
       line = line(21:)
!      write(*,*) trim(line)
       i=i+1
       n = len_trim(line)/10
       write(fm,'(a,i0,a)') '(', n, 'f10.5)'
!      write(*,*) j
       read(line,fm) px(i,(j+1):(j+n))
   end if
end do

k=0
do
   write(*,*) 'please input a number between 1 and ', nrow, 'end the program by 0.'
   read(*,*) i
   if(i==0) exit
   k=k+1
   ppx(:,k) = px(:,i)
end do

!write(*,*) k/5, mod(k,5)

if (k>=5) then
   do j=1,k/5
      do i=1,nrow
         write(13,'(5f10.5)') ppx(i,(j-1)*5+1:j*5)
      end do
      write(13,*)
   end do
end if
if (mod(k,5) /=0) then
   write(fm,'(a,i0,a)') '(', mod(k,5), 'f10.5)'
   do i=1,nrow
      write(13, fm) ppx(i,(k/5*5+1):k)
   end do
end if

end program ei

2楼2011-06-18 16:41:08
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kathy2008

木虫 (正式写手)


dubo(金币+1): 欢迎常来程序语言版讨论 2011-07-31 13:36:05
引用回帖:
Originally posted by snoopyzhao at 2011-06-18 16:41:08:
大概这个样子。只是需要手工输入轨道号(这样可能灵活一些),每次输入一个轨道序号,回车,输入 0 则结束整个程序……

[code]
program ei
real, dimension(:,, allocatable :: px,ppx
character(len=256 ...

利用该程序提取π轨道信息,报错。信息如下
At line 48 of file eigen-pai-nc3h7-r2.f
Fortran runtime error: Bad value during floating point read

google也没有找到应对之策,请高手指点。
3楼2011-07-03 15:06:57
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)


dubo(金币+1): 欢迎常来程序语言版讨论 2011-07-31 13:36:26
你的 .out 文件是咋生成的,这次的这个文件比上次的文件每一行前面多了一个空格……

所以,你把程序中:
CODE:
line = line(21:)

改成
CODE:
line = line(22:)

就可以了……
4楼2011-07-03 22:28:17
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