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shuifeng1988

金虫 (小有名气)

木虫

[求助] perl脚本求助,我想将一万多个文件从fasta格序,改为phylip4格式

求助,如何利用bioperl批量修改序列格式!我在iny文件夹中有一万多个.fasta文件,我想将它们修改序列格式为phylip4,并存在out文件夹中!我电脑上已经装好bioperl,请问怎么写脚本??
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平生两愿:抱着美人,浪迹天涯!
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xioooli

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
jjdg(金币+2): 感谢应助 2011-06-20 11:55:32
shuifeng1988(金币+5): 2011-10-12 13:30:19
话说,我粗略的看了下上述两种格式,简单的脚本就能解决,用不着什么bioperl的大炮吧,
google 大神给出的两个貌似能解决问题的链接:

python 版本
http://miss.ieph.net/archives/970

awk 版本
http://www.unix.com/shell-progra ... -phylip-format.html
2楼2011-06-19 22:45:55
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