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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 药学 » 药物分析 » 指纹图谱问题
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pang0807

新虫 (初入文坛)

[求助] 指纹图谱问题

各位高手~~本人第一次接触指纹图谱，想请教各位几个问题，在做指纹图谱的时候，用2004A版处理谱图设置参照谱的时候时间窗一般设置多少呢？什么情况下用平均数什么情况下用中位数呀？选参照谱图有什么讲究吗？非常感谢~~~

另外，相对保留时间和相对峰面积是不是得自己算呢？？
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长乐未央
1楼 2011-06-08 15:52:30
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chfpl_1

金虫 (著名写手)
现在都是软件积分计算的，自己计算没想过，太难了呵
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天下无易事，有恒者得之。
2楼2011-06-08 16:01:33
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小神-小神

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
karl2100(金币+1): 谢谢！ 2011-06-09 19:29:16
1.时间的长短和你的谱图有关系吧，一般来说，最初的5分钟是溶剂峰是要切掉的。
2.参照谱图一般选择你导入的第一幅图即可。
3.相对保留时间和相对峰面积，你用的软件不能给出，只能自己用EXCEL算，所以需要从从液相工作站导出所有图谱的保留时间和峰面积。自己选择参比峰，自己算。
4.至于你说的“中位数”什么的……没什么用。
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纵横四海
3楼2011-06-09 13:58:45
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jwr

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

2004A版算是比较好用的，当年我博士毕业论文也是用的这软件！
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4楼2011-06-11 16:45:37
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threey2008

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
qinhy(金币+1): 多谢回帖~~~ 2011-06-14 19:26:40
时间窗的设置--时间设置太小，匹配效果会很差，时间适当（一般0.5min较好）
平均数和中位数差别不是很大
选参照图谱--选择共有峰较多的图谱，匹配的相似度会提高很多，数据好看一些。
相对保留时间和相对峰面积这个软件中好像没有，得自己算。
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生活需要改变
5楼2011-06-13 10:44:06
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ambition09

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
novus(金币+2): 谢谢交流，欢迎常来药学版！ 2011-06-24 19:59:13
它自带的帮助系统里说得比较明白:

（3）色谱峰匹配

色谱峰匹配包括指定参照峰，指定基准峰和自动匹配。下面逐一介绍：

·       指定参照图谱：用户可以任意选择一条色谱图谱作为指定参照图谱。点击“谱图处理”®“色谱峰匹配”中的“指定参照图谱”，弹出如图14所示的对话框，选择参照图谱编号“确定“后即可将该编号对应的图谱指定为参照图谱。图谱颜色变为红色，以区别于其他图谱。

在此对话框中还提供了“对照图谱的生成方法”和“时间窗宽度”的参数设置。“对照图谱的生成方法”（详见“3 谱图处理中（4）生成对照图谱、单独显示对照图谱及导出对照图谱”），这里只介绍“时间窗宽度”的参数设置。时间窗宽度是指相对于参照图谱峰位置的可选保留时间范围，其单位根据横坐标轴的单位而定（这里是分钟）。时间窗宽度越大，可选的时间范围就越大。在色谱峰匹配时，选择一个合适的时间窗宽度是非常重要的。一般情况下，时间窗宽度在较小范围内变化（如0.1-0.5），自动匹配结果变化较大。时间窗宽度在较大范围内变化（如0.5-1.5），自动匹配结果比较稳定。建议：先在一定范围内逐渐增加时间窗宽度（如0.1-1.0），然后观察匹配结果（可以通过相似度的计算结果确定）。若时间窗宽度增加到一定数值后，匹配结果比较稳定（相似度计算结果稳定），这时对应的时间窗宽度参数较为适合。
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6楼2011-06-24 19:58:26
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