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长鑫

木虫 (正式写手)

[求助] P450酶

最近拿到的课题是某微生物对P450酶的作用机理的研究,自己补了大量的知识,可是说实话,光靠自己是无法提高效率的,所以我想到了各位虫友,又一次需要大家的慷慨帮助!

具体问题如下:
1.我看了一些关于国外研究微生物的P450酶作用机理研究的文章,但是我很不解的是他们是如何知道P450酶的基因位点的,从而设计引物进行PCR扩增目的基因片段。(有虫友肯定说用NCBI,我试过没找到,当然也可能是由于自己不太会用的原因,但是如果你知道,请你告诉我,非常感谢)
2.我想问一下,对于微生物进行鉴定所进行测序的ITS序列中可以进行P450酶位点的确定么?(我个人觉得不能,但是想听一下大家的经验并求证)
3.进行微生物基因组全序列测序一定是一个很浩大的工程吧,那如果送去测的话,会需要多少钱呢?
4.大家设计引物的时候是用的Vector NT的软件么?我发现我安装的不能进行网络测试的联网使用,而且新建序列的时候不能使用粘贴功能,这导致我没有心情做下去了,大家是怎么弄的?还需要大家的很多经验知道,自己是非常非常新的新手,希望大家不要吝惜自己的经验,非常感谢大家!
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

★ ★
1949stone(金币+2): 鼓励西瓜 2011-06-05 16:17:07
帮顶下。问题好多啊,偶都不懂
Vector NTI可能是没注册or破解,可以在论坛里搜索下个破解版的。
不过引物设计方面,个人感觉Vector NTI不强,建议你试试Primer Premier或者Oligo等。
2楼2011-06-02 22:59:00
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长鑫

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-06-02 22:59:00:
帮顶下。问题好多啊,偶都不懂
Vector NTI可能是没注册or破解,可以在论坛里搜索下个破解版的。
不过引物设计方面,个人感觉Vector NTI不强,建议你试试Primer Premier或者Oligo等。

谢谢你啊,现在在设计实验方案,觉得最头疼的是实验的前提,那我试试看Primer Premier或Oligo看看。

继续等待虫友相助!
3楼2011-06-03 12:40:49
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terry130

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
西瓜(金币+2): 热心! 2011-06-03 18:35:28
长鑫(金币+2): warmhearted,非常感谢,继续等待能够回答问题的虫友! 2011-06-03 21:02:58
设计引物的话还是primer5好点,NTI用来比对序列结构和作图要好些。小木虫上有破解的NTI,你找不到的话可以在这里留贴,传一个给你~
摒气动方息,宁神心自明。
4楼2011-06-03 16:27:01
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长鑫

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by terry130 at 2011-06-03 16:27:01:
设计引物的话还是primer5好点,NTI用来比对序列结构和作图要好些。小木虫上有破解的NTI,你找不到的话可以在这里留贴,传一个给你~

上来回帖前,我在网上找到了破解版,刚装好了,也绿色注册了,呵呵,现在可以试试看,不行就再问你要,谢谢你
5楼2011-06-03 21:04:04
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长鑫

木虫 (正式写手)

怎么还没有人啊。。。。
6楼2011-06-05 12:07:14
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
Originally posted by 长鑫 at 2011-06-05 12:07:14:
怎么还没有人啊。。。。

呵呵,怎么,还没解决吗?
7楼2011-06-05 12:45:43
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长鑫

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-06-05 12:45:43:
呵呵,怎么,还没解决吗?

好郁闷,实验方案何时才能设计好啊,这些是例题依据,看的文献里人家也没讲这一部分,我就到处刨,郁闷啊,不过还是谢谢你!
8楼2011-06-05 16:06:59
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
Originally posted by 长鑫 at 2011-06-05 16:06:59:
好郁闷,实验方案何时才能设计好啊,这些是例题依据,看的文献里人家也没讲这一部分,我就到处刨,郁闷啊,不过还是谢谢你!

让老板出手啊,或者让老板给你介绍做过这方面的人或者单位,你去联系他们。
光看了你问的引物设计的问题,其他问题我也不懂呢
9楼2011-06-05 18:20:15
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长鑫

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-06-05 18:20:15:
让老板出手啊,或者让老板给你介绍做过这方面的人或者单位,你去联系他们。
光看了你问的引物设计的问题,其他问题我也不懂呢

呵呵,老板不是做这个领域的,呵呵,目前是想让我先设计一下,然后再送其他老师那里审,呵呵,我也不想太丢人,所以就想多了解了解,到时候送审不至于大动干戈的要全修,呵呵
10楼2011-06-06 13:46:47
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