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yuxia82012木虫 (著名写手)
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gel-shift蛋白结合DNA的问题
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最近做gelshift研究蛋白与DNA的结合,在用不同量得蛋白与DNA反应后,跑5%的非变性聚丙烯酰胺凝胶,扫图见下,这个结果看出来是结合了,但是感觉有点不正常,主要是跑完后,在同样的曝光度下,蛋白量加的多的泳道DNA信号很弱,加大曝光度后可以明显看见上面有结合,不知道这是不是有问题,怎么证明这个蛋白是特异结合这段DNA而不是随便什么DNA都能结合呢? |
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楼主这个体系里面加非特异性竞争DNA了吗,鲑精DNA或者polyDIDC都可以,如果加了50倍或100倍的竞争DNA还是有明显的结合,那应该就是真的了。然后再做DNA足迹(DNase I footprinting)可以找到具体的结合位点。DNA足迹自己做可能不太好做,需要专门的平台,一般实验室都没有,这个可以去找公司。我们实验室是在上海吐露港生物科技有限公司做的,他们直接给我们做好能发表的图,现在文章已经发了。楼主可以看一下, J. Bacteriol.-2013-Wang-2595-602 他们公司网址:www.tolobio.com 电话:400-032-6070 邮箱:support@tolobio.com 直接打电话跟他们联系就行,发邮件也行。 |
22楼2015-05-20 09:45:07
yuxia82012
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2楼2011-06-03 09:43:16

3楼2011-06-23 09:05:30
yuxia82012
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4楼2011-06-23 10:40:16













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