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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 序列比对
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happy2011

金虫 (小有名气)

[求助] 序列比对

请问高手们，序列比对用哪个软件，具体怎么操作。谢谢。正向反向怎么比对
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实验操作

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1楼 2011-06-02 19:15:06
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夏风随影

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

happy2011(金币+2): 谢谢 2011-06-13 09:33:37
Clustal W 2.1 用来对核酸与蛋白序列进行多序列比对（multiple sequence alignment）的软件。
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有情调的生活~~
3楼2011-06-02 21:35:19
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chicharito

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

happy2011(金币+2): 谢谢 2011-06-13 09:33:23
DNAMAN  有个多重比对，也有反向互补序列
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姿态----
2楼2011-06-02 21:17:02
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zrr807

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

happy2011(金币+2): 谢谢 2011-06-13 09:34:20
可以用NCBI在线比对，设置相关参数内容就可以了
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快乐的样子！
4楼2011-06-03 09:05:38
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yabxxh

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

看天(EPI+1): 谢谢回答 2011-06-03 10:03:33
happy2011(金币+4): 谢谢 2011-06-13 09:34:50
用NCBI中blast中的align two sequences，你可以先用你的目的序列和测序结果比较一下，看清楚是正向还是反向互补，确定了方向之后，分别输入你测序的两条结果，看中间是不是有重合部分，有的话，恭喜，你的片段已经测通了，然后取重叠部分前端的序列+重叠部分+重叠部分后端的序列就是你的全序列，拿去和你的目的序列再做一个align two sequences你就得到结果了，好运
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5楼2011-06-03 09:36:03
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