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kaegi金虫 (小有名气)
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高斯09的溶剂化能到底包含哪几项？
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以前用高斯03的时候溶剂化能都是用SCFVAC命令可以直接得到溶剂化能 ======================= Total free energy in solution: with all non electrostatic terms (a.u.) = -40.515696 -------------------------------------------------------------------- (Unpolarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -0.17 (Polarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -0.17 Solute polarization (kcal/mol) = 0.00 Total electrostatic (kcal/mol) = -0.17 -------------------------------------------------------------------- Cavitation energy (kcal/mol) = 5.62 Dispersion energy (kcal/mol) = -6.15 Repulsion energy (kcal/mol) = 1.51 Total non electrostatic (kcal/mol) = 0.98 DeltaG (solv) (kcal/mol) = 0.81 例如上面这个用高斯03计算出来的溶剂化能取DeltaG一项。其中包括静电作用项（total electrostatic)和非静电作用项(Total non electrostatic)。 高斯09是推荐用smd溶剂化模型计算溶剂化能，但是输出显示的是 SCF Done: E(RB3LYP) = -40.5164428887 A.U. after 7 cycles Convg = 0.7143D-09 -V/T = 2.0080 KE= 4.019441594569D+01 PE=-1.205021820324D+02 EE= 2.610394409625D+01 SMD-CDS (non-electrostatic) energy (kcal/mol) = 0.54 似乎只包含了非静电相互作用能，这与高斯03相比岂不是少了一项能量？ 看高斯手册上说L124可以进行state-specific and external iteration SCRF calculations。另一种办法是单独计算分子的气相能量和溶剂中的能量，然后相减，得到溶剂化能。 我的问题是：高斯09有没有什么办法可以通过只添加一个参数啊，命令啊就能计算得到溶剂化能？溶剂化能到底是否应该包含静电作用能，为什么高斯09推荐的命令里不包含这一项了？如果不能通过添加命令直接计算得到溶剂化能，那么如何修改IOP调用L124进行计算？ [ Last edited by kaegi on 2011-6-2 at 16:37 ] |
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