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rock0927

铁虫 (正式写手)

[求助] 过渡态计算

最近刚接触gaussian,要做一个反应物过渡态的计算,两种反应物,一种产物,物质均比较简单。请问具体应该怎么做,怎样构建两种反应物的结构,迷惘中,请高人指点。
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dx357

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

rock0927(金币+2): 多谢 2011-06-02 10:41:16
引用回帖:
Originally posted by rock0927 at 2011-06-02 00:03:51:
最近刚接触gaussian,要做一个反应物过渡态的计算,两种反应物,一种产物,物质均比较简单。请问具体应该怎么做,怎样构建两种反应物的结构,迷惘中,请高人指点。

你的问题是不是不知道怎么把两个反应物弄到一块吧。首先你把两个反应物放到一个窗口下,距离尽可能的拉远点,然后优化,就构建好了一个反应物。在知道产物,先用qst2试试找过渡态。
tiandaochouqin...war craft
5楼2011-06-02 09:09:01
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yongma2008

木虫 (著名写手)

论文?苦!主。

怎样构建两种反应物的结构,迷茫中。。。。

知道反应物的话,用gv画一下就好了啊
2楼2011-06-02 04:17:45
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uminj

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

rock0927(金币+1): 多谢 2011-06-02 08:39:55
计算过渡态有好几种方法,不过最有效的方法是先根据有机反应机理设计过渡态,对设计的过渡态优化后,用IRC验证是否可以从你所设计的过渡态得到你的反应物和产物。
3楼2011-06-02 07:44:03
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wenxianliu

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

rock0927(金币+1): 多谢 2011-06-02 08:40:02
你的反应属于 A+B----> C 。一般找过渡态有三种方法:TS,QST2和QST3。TS方法比较好用,需要找到反应的进攻点,猜想一个过渡态。对于刚入门的同学,可以看gaussian自带的例子和练习。
4楼2011-06-02 08:34:48
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