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happy111839

铜虫 (正式写手)

[求助] 哪位能教教我如何优化这个结构,谢谢


这是一个反应的产物,如何优化出两个产物在一起的结构,用的是DFT/B3LYP、6-31g(d)方法,谢谢了
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dewpoint

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

happy111839(金币+1): 2011-07-04 21:37:25
引用回帖:
Originally posted by happy111839 at 2011-06-09 17:09:12:
实验上推测的机理是离子的形式,自由基的我没试过,请问第一步的过渡态的结构可能是什么呢?我试了很多都不行,谢谢了

If it is a radical process, it is a H-abstraction TS. The better way to start is to just include the reaction centre first, the easiest model is the ring-NH3 abstracting the H-atom in t-BuOOH. If you find the TS of this, then adding the other part in the reactant to find the final TS you want. However, i donot know the situation you put ions in the system.
13楼2011-06-09 23:29:23
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yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

好诡异 左侧的小分子是O-O键吗?
2楼2011-05-31 21:50:58
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yongma2008

木虫 (著名写手)

论文?苦!主。

放一起优化,肯定会把那个=NH2中的一个H原子给夺了去。
3楼2011-05-31 22:25:48
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happy111839

铜虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by yongma2008 at 2011-05-31 22:25:48:
放一起优化,肯定会把那个=NH2中的一个H原子给夺了去。

是,但是这是我做的反应的中间一步(实验推测机理),我该怎么解决这个问题呢
4楼2011-05-31 22:32:18
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