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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 求助：bayes 建树9天了，怎么还是得不到收敛的树？？
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myco_lei

金虫 (小有名气)

[求助] 求助：bayes 建树9天了，怎么还是得不到收敛的树？？

bayes 建树9天了，怎么还是得不到收敛的树？
我用了84条序列，每条长2557；用的是LSU和mtssu联合建树，结果跑了9天了，一直在0.09左右徘徊?
  请高手指点，这是怎么回事啊？如果继续的话，能得到收敛的树吗？
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1楼 2011-05-30 16:19:23
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~！
好长啊，2kb多，我看过师兄们建树，有的跑一个月的都有，呵呵，如果没有出错，应该没有什么问题吧，就是怕断电啊。。。
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2楼2011-05-30 16:31:24
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myco_lei

金虫 (小有名气)
上次就不小心被关了，现在真是担心它啊！
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3楼2011-05-30 17:04:05
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iorimouse

新虫 (小有名气)
bayes建树太慢了，你序列2k多，80多条序列，弄不好真要1个月。我用PAUP构树，700个bp都算不下去了，电脑开一个月非爆了不可。
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4楼2011-05-31 09:53:56
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myco_lei

金虫 (小有名气)
我 用PAUP建还挺快的。你建的时候参数是怎么设置的？怎么会那么慢呢？
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5楼2011-05-31 14:54:13
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iorimouse

新虫 (小有名气)
114条序列，ML法构树，启发式搜索，重复1000次
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6楼2011-06-25 14:33:56
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hsskcc

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我也是出现了这样的问题，最少两个星期才降到0.01以下，听老师说可以改变其中的热链的值
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7楼2012-12-24 22:35:10
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