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myco_lei

金虫 (小有名气)

[求助] 求助:bayes 建树9天了,怎么还是得不到收敛的树??

bayes 建树9天了,怎么还是得不到收敛的树?
我用了84条序列,每条长2557;用的是LSU和mtssu联合建树,结果跑了9天了,一直在0.09左右徘徊?
  请高手指点,这是怎么回事啊?如果继续的话,能得到收敛的树吗?
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xp198766

铁杆木虫 (著名写手)

小木虫职业打酱油滴~~!

好长啊,2kb多,我看过师兄们建树,有的跑一个月的都有,呵呵,如果没有出错,应该没有什么问题吧,就是怕断电啊。。。
2楼2011-05-30 16:31:24
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myco_lei

金虫 (小有名气)

上次就不小心被关了,现在真是担心它啊!
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3楼2011-05-30 17:04:05
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iorimouse

新虫 (小有名气)

bayes建树太慢了,你序列2k多,80多条序列,弄不好真要1个月。我用PAUP构树,700个bp都算不下去了,电脑开一个月非爆了不可。
4楼2011-05-31 09:53:56
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myco_lei

金虫 (小有名气)

我 用PAUP建还挺快的。你建的时候参数是怎么设置的?怎么会那么慢呢?
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5楼2011-05-31 14:54:13
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iorimouse

新虫 (小有名气)

114条序列,ML法构树,启发式搜索,重复1000次
6楼2011-06-25 14:33:56
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hsskcc

新虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

我也是出现了这样的问题,最少两个星期才降到0.01以下,听老师说可以改变其中的热链的值
7楼2012-12-24 22:35:10
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