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shenailin

木虫 (正式写手)

[求助] 存在原子转移的分子怎么添加溶剂化效应

要计算原子转移的过渡态(加溶剂化效应),但是总是出现这样的错误,马上就停了
UA0: Hydrogen   23 is unbound. Keep it explicit at all point on the
UA0: potential energy surface to get meaningful results.
Error termination via Lnk1e in /opt2/g03/l301.exe at Thu May 26 16:08:33 2011.

搜索了一下,找到一下两种解决方法
1. Scfvac
   radii=uahf
2. Sphereonh=N
但是都没有起到效果

输入作业如下
%nproc=4
%chk=gn13_cts_M_water
%mem=1000Mb
#P B3LYP/GEN opt=(TS,CalcFC,noeigen) scrf=(pcm, solvent=water) scf(maxcycle=1000) freq=noraman
请高手相助,已经为此困惑了好长时间了。若是能解决问题,必有重谢!
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独唱团

金虫 (正式写手)

Hydrogen   23 is unbound. Keep it explicit at all point on the potential energy surface to get meaningful results.
我觉得是结构有问题。
2楼2011-05-29 16:59:27
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shenailin

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by 独唱团 at 2011-05-29 16:59:27:
Hydrogen   23 is unbound. Keep it explicit at all point on the potential energy surface to get meaningful results.
我觉得是结构有问题。

不是结构的问题啊!同样的结构再气相中计算是可以的。但加了溶剂化效应后就不行了。
3楼2011-05-30 08:56:48
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zhangl2011

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

shenailin(金币+5): 2011-06-02 12:08:32
好像存在原子转移的分子不能用UAO模型,换成Radii=UAKS试试可不可以?
计算化学学习中
4楼2011-05-31 11:14:35
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shenailin

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhangl2011 at 2011-05-31 11:14:35:
好像存在原子转移的分子不能用UAO模型,换成Radii=UAKS试试可不可以?

我试一下,谢谢回复赠送了红花,不知道加上没有。
5楼2011-06-01 14:46:39
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shenailin

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhangl2011 at 2011-05-31 11:14:35:
好像存在原子转移的分子不能用UAO模型,换成Radii=UAKS试试可不可以?

在作业最后空一行加Radii=UAKS还是不行,出现同样的错误。请高手继续执教
6楼2011-06-01 15:10:27
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kaegi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

shenailin(金币+3): 2011-06-02 12:08:50
引用回帖:
Originally posted by shenailin at 2011-06-01 15:10:27:
在作业最后空一行加Radii=UAKS还是不行,出现同样的错误。请高手继续执教

不同的半径在处理氢原子时是不同的,具体有什么不同请行查阅高斯手册。两个半径都不行为什么不试试别的呢。bondi半径试试看吧。其他半径手册也有,不妨都试试。
7楼2011-06-01 17:05:49
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spearous

金虫 (正式写手)

从你的输入看:scrf=(pcm, solvent=water),如果想用sphereonh=N 命令指明会动的原子,那么在scrf里要加read,去读sphereonh的参数,比如:
scrf=(pcm, solvent=water,read)
在坐标输入之后
sphereonh=N

这样就可以了。
8楼2013-04-05 05:21:01
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