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yexuqing木虫之王 (文学泰斗)
太阳系系主任
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利用数据库确定蛋白结构的新方法已有6人参与
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利用数据库确定蛋白结构的新方法 由于“蛋白数据库”(Protein Data Bank)现已有超过6万个结构，所以经常有可能创建基于同源性的模型，来帮助确定具有一个未知三维结构的某一蛋白的X-射线晶体结构。但当人们所感兴趣的蛋白的序列与已知结构的符合程度不到30%时，当前的方法通常会失败。一种能够克服这一局限性的新方法已经建立，并成功地用在了13个X-射线衍射数据集的8个当中，它们用传统方法是不能得到解析的。只要分辨率为3.2埃或更好、在非对称单元中有四个或更少的版本、且已有“序列身份”(sequence identity)符合度超过20%的同源蛋白的结构，那么在当前方法会失败的一半以上的情形中，该新方法应能在没有实验“相信息”(phase information)的情况下快速确定蛋白的结构。 Letters to Nature p.540 doi:10.1038/nature09964 要约 全文 PDF |
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