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dreamyeye

木虫 (著名写手)

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[求助] G3large基组

想用G3方法，文献说其中有个large基组，大约为mp2/6-31+g(3d2f,2df,2p),但又有一些不同。具体的基组，文章中说列在一个网站里，http://chemistry.anl.gov/compmat/，但是这个网站又禁止我访问，不清楚是什么原因，有没有大侠帮忙告知一下G3large基组到底具体是什么

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1楼 2011-05-22 00:28:59

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

zhangmt

至尊木虫 (著名写手)

我叫MT

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
dreamyeye(金币+3): 十分感谢 2011-05-22 09:20:27
gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-22 10:24:22
dreamyeye(金币+3): 感谢 2011-11-17 21:01:09

This file contains the G3large basis set used in the MP2(full) calculation
in G3 theory.

Reference: "Gaussian-3 theory for molecular energies of first- and
second-row compound" L.A. Curtiss, K. Raghavachari, P.C. Redfern,
V.Rassolov, and J. A. Pople, J. Chem. Phys.  109, 7764 (1998).

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  P  2 1.00
      5.504500  6.168248E-01
      2.243300  4.402946E-01
  P  1 1.00
      0.776200  1.000000E+00
  P  1 1.00
      0.291900  1.000000E+00
  P  1 1.00
      0.102900  1.000000E+00
SP 1 1.00
.4050000000D-01 .1000000000D+01 .1000000000D+01
D 1 1.00
.2600000000D+01 .1000000000D+01
D 1 1.00
.6500000000D+00 .1000000000D+01
D 1 1.00
.1625000000D+00 .1000000000D+01
F 1 1.00
.1100000000D+01 .1000000000D+01
F 1 1.00
.2750000000D+00 .1000000000D+01
D 1 1.00
  0.11000000000000D+02  0.1000000000D+01
F 1 1.00
  0.10000000000000D+02  0.1000000000D+01
****
-cl
  S  6    1.00
105819.000000  7.423627E-04
   15872.000000  5.747318E-03
   3619.650000  2.964876E-02
   1030.800000  1.178998E-01
   339.908000  3.648532E-01
   124.538000  5.816968E-01
  S 3    1.00
   124.538000  1.370443E-01
      49.513500  6.231380E-01
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  S 1    1.00
      6.464800 .100000D+01
  S 1    1.00
      2.525400 .100000D+01
  S 1    1.00
      0.537800 .100000D+01
  S 1    1.00
      0.193500 .100000D+01
  P 4    1.00
   589.780000  7.873332E-03
   139.850000  6.155460E-02
      44.795000  2.742514E-01
      16.612000  7.498994E-01
  P 2    1.00
      6.599500  6.147640E-01
      2.714100  4.413416E-01
  P 1    1.00
      0.952800 .100000D+01
  P 1    1.00
      0.358000 .100000D+01
  P 1    1.00
      0.125000 .100000D+01
SP 1 1.00
.4830000000D-01 .1000000000D+01 .1000000000D+01
D 1 1.00
.3000000000D+01 .1000000000D+01
D 1 1.00
.7500000000D+00 .1000000000D+01
D 1 1.00
.1875000000D+00 .1000000000D+01
F 1 1.00
.1400000000D+01 .1000000000D+01
F 1 1.00
.3500000000D+00 .1000000000D+01
D 1 1.00
  0.13000000000000D+02  0.1000000000D+01
F 1 1.00
  0.12000000000000D+02  0.1000000000D+01
****
-ar
  S  6 1.00
118022.000000  7.461902E-04
   17683.500000  5.786362E-03
   4027.770000  2.990098E-02
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  S  3 1.00
   138.160000  1.435931E-01
      54.989100  6.231142E-01
      23.170700  2.840810E-01
  S  1 1.00
      7.377860  1.000000E+00
  S  1 1.00
      2.923690  1.000000E+00
  S  1 1.00
      0.650405  1.000000E+00
  S  1 1.00
      0.232825  1.000000E+00
  P  4 1.00
   663.062000  7.820021E-03
   157.093000  6.148333E-02
      50.231100  2.754731E-01
      18.635300  7.488402E-01
  P  2 1.00
      7.446540 -6.282210E-01
      3.095700 -4.260202E-01
  P  1 1.00
      1.106460  1.000000E+00
  P  1 1.00
      0.415601  1.000000E+00
  P  1 1.00
      0.145449  1.000000E+00
SP 1 1.00
  0.6000000000D-01  0.1000000000D+01  0.1000000000D+01
D 1 1.00
  0.3400000000D+01  0.1000000000D+01
D 1 1.00
  0.8500000000D+00  0.1000000000D+01
D 1 1.00
  0.2125000000D+00  0.1000000000D+01
F 1 1.00
  0.1700000000D+01  0.1000000000D+01
F 1 1.00
  0.4250000000D+00  0.1000000000D+01
D 1 1.00
  0.15000000000000D+02  0.1000000000D+01
F 1 1.00
  0.14000000000000D+02  0.1000000000D+01
****

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一群自以为正义凛然的年轻人将一切不能以科学解释的事情定性为封建迷信并大刀阔斧地进行消灭，其实这是修养不足学识浅薄的一种体现，也是可恶的偏执和愚蠢的自以

2楼2011-05-22 08:50:14

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Originally posted by zhangmt at 2011-05-22 08:50:14:
This file contains the G3large basis set used in the MP2(full) calculation
in G3 theory.

Reference: "Gaussian-3 theory for molecular energies of first- and
second-row compound" L.A ...

还有一个问题，就是说这个系数里面的d是什么意思？以前用过的手工输入的基组基本都是e的，能否告知，谢谢。

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3楼2011-05-22 09:21:40

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引用回帖:

而且，有时每一行有3个数，这也是我以前没有遇到过的，能否解释一下，谢谢。

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4楼2011-05-22 09:23:08

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gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-22 14:18:06
dreamyeye(金币+2): 谢谢 2011-05-22 23:56:52

引用回帖:

Originally posted by dreamyeye at 2011-05-22 00:28:59:
想用G3方法，文献说其中有个large基组，大约为mp2/6-31+g(3d2f,2df,2p),但又有一些不同。具体的基组，文章中说列在一个网站里，http://chemistry.anl.gov/compmat/，但是这个网站又禁止我访问，不清楚 ...

使用Gaussian软件的话不用自己去一步一步的算
直接在命令行写上一个 G3关键词就行了

不过推荐使用CBS-QB3代替G3，精度类似甚至还好一点，计算量小的多了。

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据权威报纸调查，84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历，故应该禁止经营电子游戏。据我们所知，100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历，故制鞋厂应该停业。

5楼2011-05-22 13:51:40

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【答案】应助回帖

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gmy1990(金币+3): 非常感谢你对论坛的贡献，奖励一下！ 2011-05-22 18:39:38
dreamyeye(金币+2): 感谢解释，虽然有误 2011-05-23 00:04:02

1、关于输入输出的格式中，字母D的问题：在浮点型数字的输入输出时，为了获得尽量多的有效数字，习惯上计算机采用科学计数法，也就是把数字分为两个部分，写成A*10^B这样的格式，其中A为1-10之间的浮点小数，B是10的指数部分，为整数，最初计算机编程的设计上将这二者之间用E隔开，表示后面的数字是指数部分(Exponent)，有的语言用小写e，有的语言用大写的E，没有区别。后来由于科学计算对数字的精度要求超级严格，单精度浮点数计算产生的误差大于我们需要的标准，所以多数计算机编程语言支持双精度的浮点数计算，此时的输入输出改用D来隔离，表示双精度的意思（Double precision）。这个你知不知道都没关系，不影响你的计算。
2、关于每行的数字问题：Gaussian使用的基组多位GTO类型，为了能够更精确地表达STO，经常需要多个GTO来拟合一个STO，也就是比如：
c1*exp(-b1*r^2) + c2*exp(-b2*r^2) + c3*exp(-b3*r^2)之类的。基组中给出的初始猜就是这个组合中的c1 c2 c3 b1 b2 b3之类的参数，其中c1 c2 c3我们习惯称为系数，b1 b2 b3称为指数。如果不用多个GTO组合，那么，仅仅给出b1 c1即可，也就是你经常看到的每行两个数字，如上例中，第一个H的基组：
-H 0
S 3 1.00
0.3386500000D+02 0.2549380000D-01
就是说，这个STO其实就是 0.0254938*exp(-33.865 r^2)
为了计算上更加省事，在能够用尽量少的函数就能拟合出充分精度的结果时，我们可以让部分处于相同层的s轨道和p轨道用同样指数的GTO函数来组合而成STO——当然，要各自采用不同的系数，这个时候，轨道就写成SP，表示s和p轨道的基函数在指数级别上是简并的，只靠系数不同来区分各自的行为，这个时候再给出的初始猜就是只用给出一个指数，两个系数即可，也就是你看到的每行三个数字的时候，同样以上面的例子中，C的2s 2p轨道的基函数为例：
SP 3 1.00
0.2096420000D+02 0.1146600000D+00 0.4024870000D-01
此意味着：
C 2s (STO1)=0.11466 * exp(-20.9642 r^2)
C 2p (STO1)=0.0402487 * exp(-20.9642 r^2)
可以看出，他们的指数部分相同，而系数不同。
注意，我只列了其中一个STO，而从SP后面的3可以看出，这是个劈裂基组，也就是要3个STO组合起来才代表2s或者2p的轨道波函数。前述的H的例子，也是个裂分的基组。
其实，这两个答案，如果你简单的计算，是不需要知道的。。。直接用就是了。不过，多学一点没有坏处，懂一些总比不懂要好些。。呵呵。。祝好。

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6楼2011-05-22 18:36:05

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痛苦啊，刚才着急写了回帖，没有审核就发出去了。
文中关于劈裂基组的描述有误，以上两个例子中的情况，并非劈裂基组，而是压缩型GTO基组，因此后面给出的关于STO的描述公式是错误的，版主能否改成非应助贴，让我修正一下。。。否则，误人子弟，罪过罪过。。。

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7楼2011-05-22 18:52:12

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引用回帖:

Originally posted by zhangmt at 2011-05-22 18:52:12:
痛苦啊，刚才着急写了回帖，没有审核就发出去了。
文中关于劈裂基组的描述有误，以上两个例子中的情况，并非劈裂基组，而是压缩型GTO基组，因此后面给出的关于STO的描述公式是错误的，版主能否改成非应助贴，让我 ...

呵呵，还是谢谢，就不用麻烦斑竹了吧，要不再发一条，把错误的地方改过来。谢谢

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8楼2011-05-23 00:02:57

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