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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » QE(Pwscf) » 用Xcrysden制作原子振动的动画的问题
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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gemucai

木虫 (正式写手)

[求助] 用Xcrysden制作原子振动的动画的问题

gamma点的频率算出来了，输出文件为*.dynG，我用dynmat.x作用于*.dynG文件上，得到了axsf文件，但是我发现了一个问题。那就是在这个axsf文件中，虽然给出了原子所受的力，但是每一步动画对应于每一个振动模式，并且原子的相对位置都是不变的！

我想要的是把每个振动模式分开，分成很多步动画，看在每个振动模式下原子如何振动，应该如何做？谢谢！
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1楼 2011-05-19 08:41:04
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gemucai

木虫 (正式写手)
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢交流。 2011-11-17 12:47:00
引用回帖:
11楼: Originally posted by meng303 at 2011-11-17 09:34:45:
谢谢啊，新手上路很多都不懂，请问计算出来的频率是不是和温度没有关系，那又怎么解释温度越高，分子振动越剧烈呢？计算的声子频率和平常所说的振动频率是不同的概念吗？

热是大量分子集体运动的宏观反映，所以频率和温度是有关系的。声子是由固体内部大量原子振动共同激发而形成的，所以一般的分子是没有声子概念的。所以分子的振动频率并不是声子频率，而在固体中振动频率一般指声子频率。
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12楼2011-11-17 10:36:34
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watermall

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-06-05 22:24:18
gemucai(金币+2): 谢谢，这个我知道。如何用xcrysden读出PWSCF的声子振动输出文件是我不懂的地方。 2011-06-16 08:02:20
引用回帖:
Originally posted by gemucai at 2011-05-19 08:41:04:
gamma点的频率算出来了，输出文件为*.dynG，我用dynmat.x作用于*.dynG文件上，得到了axsf文件，但是我发现了一个问题。那就是在这个axsf文件中，虽然给出了原子所受的力，但是每一步动画对应于每一个振动模式，并 ...

用xcrysden打开axsf文件后，在display菜单里把forces选择了就行了
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2楼2011-06-05 19:28:18
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iamikaruk

木虫 (著名写手)
★
youzhizhe(金币+1): 谢谢提示。 2011-06-06 10:56:29
不妨试试用v_sim，这个动画效果比较好
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[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
3楼2011-06-06 00:57:28
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gemucai

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by iamikaruk at 2011-06-06 00:57:28:
不妨试试用v_sim，这个动画效果比较好

请问这是一个什么软件，在哪里可以下载？谢谢
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4楼2011-11-07 10:27:59
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查看全部 17 个回答
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