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gemucai

木虫 (正式写手)

[求助] 用Xcrysden制作原子振动的动画的问题

gamma点的频率算出来了,输出文件为*.dynG,我用dynmat.x作用于*.dynG文件上,得到了axsf文件,但是我发现了一个问题。那就是在这个axsf文件中,虽然给出了原子所受的力,但是每一步动画对应于每一个振动模式,并且原子的相对位置都是不变的!

我想要的是把每个振动模式分开,分成很多步动画,看在每个振动模式下原子如何振动,应该如何做?谢谢!
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meng303

金虫 (小有名气)

引用回帖:
10楼: Originally posted by gemucai at 2011-11-16 14:26:18:
你好,简正振动的动画直观生动,在做报告的时候可以第一时间说清楚问题。计算出频率可以对应声子谱进行振动模式的综合分析。

谢谢啊,新手上路很多都不懂,请问计算出来的频率是不是和温度没有关系,那又怎么解释温度越高,分子振动越剧烈呢?计算的声子频率和平常所说的振动频率是不同的概念吗?
11楼2011-11-17 09:34:45
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watermall

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


mazuju028(金币+1): 谢谢交流 2011-06-05 22:24:18
gemucai(金币+2): 谢谢,这个我知道。如何用xcrysden读出PWSCF的声子振动输出文件是我不懂的地方。 2011-06-16 08:02:20
引用回帖:
Originally posted by gemucai at 2011-05-19 08:41:04:
gamma点的频率算出来了,输出文件为*.dynG,我用dynmat.x作用于*.dynG文件上,得到了axsf文件,但是我发现了一个问题。那就是在这个axsf文件中,虽然给出了原子所受的力,但是每一步动画对应于每一个振动模式,并 ...

用xcrysden打开axsf文件后,在display菜单里把forces选择了就行了
2楼2011-06-05 19:28:18
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iamikaruk

木虫 (著名写手)


youzhizhe(金币+1): 谢谢提示。 2011-06-06 10:56:29
不妨试试用v_sim,这个动画效果比较好
[img]http://osu.ppy.sh/stat2/iamikaruk-0.png[/img]
3楼2011-06-06 00:57:28
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gemucai

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by iamikaruk at 2011-06-06 00:57:28:
不妨试试用v_sim,这个动画效果比较好

请问这是一个什么软件,在哪里可以下载?谢谢
4楼2011-11-07 10:27:59
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