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ghcacj

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阿超

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Originally posted by lihb734 at 2011-05-19 07:47:51:
所以为了比较的目的,最好都在气相中进行,排除溶剂化的干扰,再比较一下。

我这里的COSMO应该不是考虑了溶剂化效应,而是Orca在计算chelpg电荷时,使用的是COSMO定义的原子半径,而高斯和gamess使用的是BW定义的原子半径,就是Breneman, Wiberg。
11楼2011-05-19 10:40:24
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boylc789

木虫 (著名写手)

独孤

请问楼主高斯中用chelpg电荷,你的Zn原子半径是如何查到的,是多少
我查手册Co的范德华半径是1.67
而查看结果文件,程序中C的半径为1.5;N的为1.7,O的为1.7,H的为1.45
不知道这是什么半径,和查到的不一样啊
有种相遇叫缘分;有种责任叫承诺;有份心情叫思念;有种痛苦叫煎熬;有种后悔叫错过;有种等待叫守候。
12楼2011-05-20 14:23:59
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ghcacj

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Originally posted by boylc789 at 2011-05-20 14:23:59:
请问楼主高斯中用chelpg电荷,你的Zn原子半径是如何查到的,是多少
我查手册Co的范德华半径是1.67
而查看结果文件,程序中C的半径为1.5;N的为1.7,O的为1.7,H的为1.45
不知道这是什么半径,和查到的不一样啊

Zn的半径我用的是Zn的UFF中的范德华半径,UFF力场中Zn的sigma参数是2.46,除以2就是1.38 我取的是1.39。呵呵。
13楼2011-05-20 14:26:09
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boylc789

木虫 (著名写手)

独孤

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Originally posted by ghcacj at 2011-05-20 14:26:09:
Zn的半径我用的是Zn的UFF中的范德华半径,UFF力场中Zn的sigma参数是2.46,除以2就是1.38 我取的是1.39。呵呵。

但是你和输出结果的C H O的比下,好像不一样吧
有种相遇叫缘分;有种责任叫承诺;有份心情叫思念;有种痛苦叫煎熬;有种后悔叫错过;有种等待叫守候。
14楼2011-05-20 18:16:13
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ghcacj

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Originally posted by boylc789 at 2011-05-20 18:16:13:
但是你和输出结果的C H O的比下,好像不一样吧

C H O 这些用的就是高斯原有的。
15楼2011-05-20 18:19:00
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boylc789

木虫 (著名写手)

独孤

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Originally posted by ghcacj at 2011-05-20 18:19:00:
C H O 这些用的就是高斯原有的。

但是C在高斯里是1.7
很奇怪呀
有种相遇叫缘分;有种责任叫承诺;有份心情叫思念;有种痛苦叫煎熬;有种后悔叫错过;有种等待叫守候。
16楼2011-05-20 18:20:19
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ghcacj

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Originally posted by boylc789 at 2011-05-20 18:20:19:
但是C在高斯里是1.7
很奇怪呀

我这里是1.5,N才是1.7
17楼2011-05-20 18:21:55
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