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misszx

金虫 (小有名气)

[求助] 求助:化合物母核和糖基的C谱信号都能分别对出来,如何确定该化合物?

各位大虾:我有一个未知化合物X,它的母核和已知化合物A的母核相同,C谱信号完全一致;X的两个糖基信号和已知化合物B的两个糖基相同,C谱信号完全一致。
请问:我如何确定该化合物结构?是否需要打二维谱?打的话,打HMQC谱还是HMBC谱?两者有何分别呢?我现在需要确定的是母核和糖基的连接顺序还是糖和糖之间的顺序?
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cddryw

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


misszx(金币+2): 是同一种溶媒,哪种糖应该已经确定了,现在就是不知道什么构型,以及和母核怎么连接 2011-05-18 11:14:13
misszx(金币+1): scifinder 上也查过了,只有类似化合物,没有一样的,但查文献对谱都不一样 2011-05-18 11:15:44
jiangchunyong(金币+1, EPI+1): 谢谢! 2011-05-18 13:28:18
也就说苷元已经确定了,而且糖的碳信号也确定了,对吧。和文献用的是同一种溶媒么?
1.首先把你认为的结构用chemdraw画下来,并在相应地方画出你的数据和对照文献的数据。并且把这个结构复制在scifinder上,看是否有相同结构,如果有,对照文献数据,如果没有,也要自己推测一个构造。
2.确定是哪种糖,需要用到的核磁技术是HOHAHA。
3.确定糖于糖之间连接位置以及糖连在苷元的哪个位置,需要用到技术是NOE。
以上两个手段确定糖的架构数据。
4.用QC和BC以及COSY确定苷元以及糖的质子数据。并用chemdraw画出BC的箭头

如果LZ真的想很严谨的完成结构进行发表,这几样是必要的,需要一点钱。
梅花精神
2楼2011-05-18 10:40:19
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cddryw

铁虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

misszx(金币+1): 2011-05-19 14:18:56
misszx  是同一种溶媒,哪种糖应该已经确定了,现在就是不知道什么构型,以及和母核怎么连接
scifinder 上也查过了,只有类似化合物,没有一样的,但查文献对谱都不一样
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1.糖的类型你如何确定的?LZ的苷元什么类型的?有几个糖?你把糖一个一个的拆掉,比方说苷元带一个糖的结构有相同结构么,或者带两糖的结构有相同结构么这样来贴SCIfinder,再或者就只把糖连一块那那个局部贴进SCI上去找,总而言之,尽量找个类似的,光靠谱是很麻烦的。
2.目前这种状况,首先自己猜测一个构型。然后打NOE,照射点是糖的端基,然后QC,BC,COSY都要打。
梅花精神
3楼2011-05-18 12:43:08
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