应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » ONIOM方法中link atom？
71/1返回列表
查看: 1830  |  回复: 6
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

charityqi

木虫 (小有名气)

[求助] ONIOM方法中link atom？

想请教大家一个问题，初学ONIOM方法，想知道QM和MM分区如果是共价键的话，必须截断了之后，用link atom饱和吗？如果是的话，那这个饱和的原子算是QM区的吗？看文献中有的提到了用原子饱和，有的没有，一直搞不懂，很纠结，不知道该怎么建模才好，恳请各位高手帮忙。万分感谢
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2011-05-15 21:20:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaegi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

charityqi(金币+1): 2011-05-22 21:37:34
直接用高斯view分层，不用在中间添加其他原子，这个程序自己会处理的。比如这个对三苯基膦的分层
赞一下 回复此楼
2楼2011-05-18 20:37:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaegi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

charityqi(金币+1): 2011-05-22 21:40:28
膦就属于QM层，三个苯基放在MM层，当然具体计算的时候还是需要你指定计算方法，并不是说你分层是把P放在高层计算的时候就放在ＱＭ层。高层的原子指定使用ＱＭ方法，对底层的原子指定使用ＭＭ方法就可以了。
赞一下 回复此楼
3楼2011-05-18 20:40:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

charityqi

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by kaegi at 2011-05-18 20:40:27:
膦就属于QM层，三个苯基放在MM层，当然具体计算的时候还是需要你指定计算方法，并不是说你分层是把P放在高层计算的时候就放在ＱＭ层。高层的原子指定使用ＱＭ方法，对底层的原子指定使用ＭＭ方法就可以了。

奥，只用gaussianview分层就可以，他自己会处理是吧？
赞一下 回复此楼
4楼2011-05-22 21:41:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaegi

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

charityqi(金币+3): 2011-05-23 19:58:46
引用回帖:
Originally posted by charityqi at 2011-05-22 21:41:03:
奥，只用gaussianview分层就可以，他自己会处理是吧？

是的，你自己在编写输入文件的时候注意对不同层的原子正确指定你想要的计算方法就可以了。
赞一下 回复此楼
5楼2011-05-23 09:12:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

kaegi

金虫 (小有名气)
忘了说了，分完层之后记得把下图中的multilayer oniom model勾选上，再按下面的retain,最后再保存为gif或者com文件
赞一下 回复此楼
6楼2011-05-23 09:58:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

charityqi

木虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by kaegi at 2011-05-23 09:58:25:
忘了说了，分完层之后记得把下图中的multilayer oniom model勾选上，再按下面的retain,最后再保存为gif或者com文件

恩，谢谢，我是这么做的，只是看没有link atom显示，以为还需要人为的加呢。呵呵
赞一下 回复此楼
7楼2011-05-23 19:58:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 charityqi 的主题更新
71/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +6 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 6/300 2026-09-15 15:02 by CgyNCDVNhGVg
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:50 by VMDqgnlKimtZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 3n8v2C8RimXI 2026-09-13 4/200 2026-09-15 14:34 by VMDqgnlKimtZ
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-15 14:22 by VMDqgnlKimtZ
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +6 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 7/350 2026-09-15 14:13 by VMDqgnlKimtZ
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +7 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 9/450 2026-09-15 14:10 by VMDqgnlKimtZ
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 QUjhNVAcOSff 2026-09-13 5/250 2026-09-15 14:02 by VMDqgnlKimtZ
[公派出国] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:58 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 6F5UbRU2I5hL 2026-09-14 3/150 2026-09-15 08:26 by C79jjtjAKjEn
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:50 by C79jjtjAKjEn
[博后之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 3/150 2026-09-15 07:34 by C79jjtjAKjEn
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-15 07:26 by C79jjtjAKjEn
[考博] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +6 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 6/300 2026-09-15 07:14 by C79jjtjAKjEn
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 4/200 2026-09-15 06:50 by 5BDX0d0WFp7t
[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-13 5/250 2026-09-15 06:38 by 5BDX0d0WFp7t
[公派出国] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 6/300 2026-09-14 22:37 by vZfe6xYu34yj
[考研] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 LwdutQ8HoqWP 2026-09-13 5/250 2026-09-14 22:25 by vZfe6xYu34yj
[考博] 上海工程技术大学激光智能制造课题组招收博士研究生 +4 两三岁ss 2026-09-14 4/200 2026-09-14 20:29 by 班主任的同桌
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 s3fFTmArrBt6 2026-09-14 4/200 2026-09-14 17:48 by Aj1rhIDL5ixY
[考博] 27秋季材料博士申请求助 10+3 Cahal1 2026-09-11 4/200 2026-09-14 08:50 by 北京莱茵编辑
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭