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li41728501

银虫 (初入文坛)

[求助] 关于基因的遗传距离

我发现自己研究的一类基因与已知的另一类基因相似度较高,所以猜测他们可能来自同一祖先,想算出遗传距离,看看他们是从什么时候开始分化开的,能不能做,怎么做啊,求指点。
PS:我用了MEGA5里面的distance下面的compute  bwteen two group distance来计算两类基因间的距离,得到的结果0.203,怎么解释,我的本意是想画进化树看看他们是从某个祖先基因的什么时候分支的

[ Last edited by li41728501 on 2011-5-13 at 17:16 ]
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andy99990000

木虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
西瓜(金币+5, EPI+1): Good! 2011-05-14 07:50:45
完全可以用2者的基因序列构建系统发育树,通过软件自带的算法就能得出你想要的差异距离。最常用的软件计算模型是MP,ML和MrBayes,再就是NJ(运算快,但现在已经渐渐淘汰,不推荐)。

软件可以分别用PAUP, PHYML和MrBayes。希望能有帮助~~
2楼2011-05-14 03:56:23
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