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构建的发育树中如果自检分数为100%,是不是就说明肯定是这个种的菌了?
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冰鱼儿
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构建的发育树中如果自检分数为100%,是不是就说明肯定是这个种的菌了?
RT 但我把我的序列BLAST后99%相近性的菌却没有是上面那个100%的种的,不知道该怎么办?
我该怎样确定这个菌的分类?
麻烦大家了!急啊 ~~~~
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2011-05-12 17:57:11
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冰鱼儿
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引用回帖:
Originally posted by
wang_xju
at 2011-05-18 17:13:47:
BLAST的算法和发育树的不是很一样,相似性有出入很正常,一般以发育树为准,你说的自检分数为100%,如果是bootstrap值,和是不是那个种没关系,如果是相似性基本可以确定是那个种。
你能帮我看看我分的对不对?
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4楼
2011-05-19 16:47:42
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2011-05-12 18:43:42
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wang_xju
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【答案】应助回帖
★ ★ ★
冰鱼儿(金币+3): 2011-05-19 16:47:01
silicare(金币+3, EPI+1): 鼓励交流,欢迎常来生物综合版 2011-05-19 21:51:59
BLAST的算法和发育树的不是很一样,相似性有出入很正常,一般以发育树为准,你说的自检分数为100%,如果是bootstrap值,和是不是那个种没关系,如果是相似性基本可以确定是那个种。
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3楼
2011-05-18 17:13:47
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