24小时热门版块排行榜    

查看: 3508  |  回复: 12
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

zhuangshl

银虫 (小有名气)

[求助] TD-DFT计算CD光谱问题

我看到很多文献采用TD-DFT判断手性分子构型归属,通过TD-DFT计算R和S型号分子的电子CD 光谱,和实验进一步对比,别确定那一种是R型,那一种是S型。

我采用DFT计算了R和S型分子的CD 光谱,但没发现区别,请问这种情况下是不是说明我选择的基组不适合我的体系呢。  我目前采用的基组:
# TD(Nstates=20) B3LYP/6-311++G*

这里如果Nstates采用40,那gauss出错无法计算。

谢谢各位的帮助。
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

xuexijisuan

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhuangshl

银虫 (小有名气)

谢谢,是的,实验方面做的是电子CD,electronic circular dichroism spectra (ECD)
我计算的也是ECD, 具体我是按照这篇论文这么做的:

Ding S et al. Absolute configurations of spiroiminodihydantoin and allantoin stereoisomers: comparison of computed and measured electronic circular dichroism spectra. Chem. Res. Toxicol. 2009, 22, 1189–1193

这篇论文结果非常好,我也能重复处理。 但针对我的R和S分子,算出来的ECD光谱却无差别, 我不知道在计算小分子吸收光谱的时候需要如何去选取基组。
3楼2011-05-11 12:09:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

blueybz

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

zhuangshl(金币+5): 谢谢您的认真回复,也希望多多指导 2011-05-11 12:09:52
引用回帖:
Originally posted by zhuangshl at 2011-05-10 16:12:45:
我看到很多文献采用TD-DFT判断手性分子构型归属,通过TD-DFT计算R和S型号分子的电子CD 光谱,和实验进一步对比,别确定那一种是R型,那一种是S型。

我采用DFT计算了R和S型分子的CD 光谱,但没发现区别,请问这 ...

你做的这个是吸收谱,不知道怎么做CD谱
2楼2011-05-11 10:31:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

8tao7

木虫 (小有名气)

对CD谱还在迷茫的飘过,感谢您的参考文献,我也要拜读下
有信仰,有目标,一步步地走,最终会实现的!
4楼2011-05-11 14:32:16
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoqy03

木虫 (著名写手)

我也是啊。两个对映异构竟然不相对。虽说差别还不算小,可是根本不是正负那么简单明了
5楼2011-05-11 15:52:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
信息提示
请填处理意见