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掺杂的周期性碳纳米管， 这样优化设置对吗？
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dmol优化碳纳米管，如图 1. 这个纯的碳纳米管优化的时候，优化了这个supercell的晶格参数，也就是a， b，c三个方向上夜都做了优化 2. 如果这个碳纳米管优化的时候，如掺杂一个Si原子，那么优化的时候还要优化晶格参数吗，还是只优化所有的原子，不用优化cell了呢？请给出详细的why，或者类似参考文献？ 3. 追加一个问题，这样的结构，优化的时候，是不是不需要统计频率呢？论坛中的好多虫子也都曾讨论过这个问题，就是周期性的体系，用dmol优化，到底能不能统计频率呢，如果优化结构的时候不选，那么做过渡态的时候，要验证有一个对应的虚频怎样办呢？   [ Last edited by zsl_321123 on 2011-5-3 at 08:24 ] |
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【答案】应助回帖
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zsl_321123(金币+10): 感谢建议，多谢 2011-05-03 21:01:42
zsl_321123(金币+10): 再送点金币给你，呵呵。。。 2011-05-08 09:07:29
youzhizhe(金币+1, 1ST强帖+1): 谢谢交流。 2011-05-09 08:41:19
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zsl_321123(金币+10): 再送点金币给你，呵呵。。。 2011-05-08 09:07:29
youzhizhe(金币+1, 1ST强帖+1): 谢谢交流。 2011-05-09 08:41:19
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首先，cell优化比不优化原则上精度高。不再优化cell都是想在合理精度前提下偷懒。这种偷懒在测试计算证明不影响作出结论的情况下，是值得鼓励的。 看你box有多大和掺杂浓度高低。如果box较大而且掺杂浓度很低，如2%以下，掺杂后不优化box也是可以接受的。 这种情况下，不再优化cell，可以满足化学精度，不影响趋势的判断。 前提：测试一下，看看晶胞和总能变化大不大。可以接受的变化就忽略吧。 |
2楼2011-05-03 20:47:55
3楼2011-05-03 20:57:18
4楼2011-05-03 20:58:32
flymice
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楼主，我现在也在模拟碳纳米管，但是不知道为什么，使用超胞建模后总是不能结构优化成功，原因不明，不知道你是怎么建立这个结构的？ 我的帖子在下面，求指导： http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3803839 |
5楼2011-12-05 19:12:11
flymice
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6楼2012-05-08 13:46:29
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flymice7楼2012-05-08 15:01:19
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9楼2012-05-09 12:56:49
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