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请教如何在blast中完成这么个任务,或者其他数据库?
agg tga agg aat atg tct cca a PHD finger protein 20
agg tga aga tat att cct cca a PTEN
请教大家,如上面序列所示,我这里有一段PTEN的序列需要序列比对查找出,相同长度内序列相差4或者5nt的基因序列,比如PHD finger 20这种序列。
但是NCBI的blast里的序列比对怎么都是连续的呢,我需要总长度不变,22nt长度的序列里和目的序列有17nt以上相同的其他序列,怎么搜索呢? |
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