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capchaline木虫 (正式写手)
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[求助]
请教如何在blast中完成这么个任务，或者其他数据库？
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agg tga agg aat atg tct cca a PHD finger protein 20 agg tga aga tat att cct cca a PTEN 请教大家，如上面序列所示，我这里有一段PTEN的序列需要序列比对查找出，相同长度内序列相差4或者5nt的基因序列，比如PHD finger 20这种序列。 但是NCBI的blast里的序列比对怎么都是连续的呢，我需要总长度不变，22nt长度的序列里和目的序列有17nt以上相同的其他序列，怎么搜索呢？ |
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keeperw
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2楼2011-04-28 16:03:47
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