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mumianke

铁杆木虫 (正式写手)

MolEPI: 1
应助: 0 (幼儿园)
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虫号: 279321
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专业: 遗传学与生物信息学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
yanruoke(金币+15): thanks a lot 2011-04-27 10:44:19
dhd997(金币+5, EPI+1): good 2011-04-27 16:58:57

1. 探针 ID “1367452_at” 这样的编号和基因是怎么对应的？
这个芯片平台是Affymetrix的，你可参照http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GPL341，有对应信息，或者到http://www.affymetrix.com/analysis/index.affx注册个用户，里面有详细的信息。
有的基因对应一个编号，有的基因对应数个探针 ID编号,因为有的基因在转录是有可变剪切，在分析时可不用考虑，先基于探针分析，最后再注释到基因。
2. 相关说明你没有看完整吧。在Samples (54)这个地方有每个样本对应的时间点及说明。每个GSM里都有详细说明。或者在下面的
Download family Format
SOFT formatted family file(s) SOFT
MINiML formatted family file(s) MINiML
Series Matrix File(s) TXT
你可以下载Series Matrix File(s) 查看其对应关系。