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成键能束缚前1/2？
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用Harmonic potential来束缚成键，势能表达式为： V=0.5k(rij-bij)2 在Ggromacs中，在top（itp）文件中键角设定如下形式： [ bonds ] ; ai aj funct c0 c1 1 2 1 0.1419747 393.0 1 17 1 0.1419747 393.0 2 20 1 0.1419747 393.0 3 4 1 0.1419747 393.0 我是想问高手，这个393是0.5k呢还只是k的值？先谢了 |
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