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piggpi

金虫 (小有名气)

[求助] 大家帮忙分析一下PCR电泳图

提鳗鱼总RNA后直接RT,接下来的PCR电泳结果如图。
我要的条带在330bp。可基本是非特异性条带。
我做的是小清蛋白克隆,以前克隆其他鱼的时候也是用同样的引物,以前没这种情况出现,有没有可能是引物降解了?
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在很久很久以前
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zxy7576

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

piggpi(金币+2): 2011-04-25 11:21:18
其实迁移率并不是很重要对于你的实验来说,但是你问了这个问题,我就找了找答案:DNA电泳的迁移率跟一下几个因素有关:DNA的分子大小及构型:不同构型DNA的移动速度次序为:供价闭环DNA(covalently closed circular,cccDNA)>直线DNA>开环的双链环状DNA。
琼脂糖浓度,这个你知道的吧;
电源电压,不要把电压加的太大;
然后就是你关心的荧光染料溴化乙啶了,用于检测琼脂糖凝胶中的DNA,染料会嵌入到堆积的碱基对之间并拉长线状和带缺口的环状DNA,使其刚性更强,还会使线状DNA迁移率降低15%。不过个人认为这个影响真的没什么的,甚至可以忽略。
还有离子强度影响。

我说的那个没有模板的空白对照,就是说没有任何其他RNA或DNA的加入的空白对照,呵呵~
不论什么时候,什么处境,都不要忘记自己最初的梦想!
12楼2011-04-25 10:05:39
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yuxia82012

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
西瓜(金币+3): good 2011-04-20 17:16:36
piggpi(金币+2): 感谢参与!!! 2011-04-21 10:22:01
你把引物做个空对照试试,就是不加模板,另外把退火温度提高点再扩增试试
在等待中涅槃重生
2楼2011-04-20 16:20:52
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)

引用回帖:
Originally posted by piggpi at 2011-04-20 16:18:10:
提鳗鱼总RNA后直接RT,接下来的PCR电泳结果如图。
我要的条带在330bp。可基本是非特异性条带。
我做的是小清蛋白克隆,以前克隆其他鱼的时候也是用同样的引物,以前没这种情况出现,有没有可能是引物 ...

看不到图片……不知道是不是我的问题……
3楼2011-04-20 17:17:16
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piggpi

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by yuxia82012 at 2011-04-20 16:20:52:
你把引物做个空对照试试,就是不加模板,另外把退火温度提高点再扩增试试

我去试试。。。。
在很久很久以前
4楼2011-04-20 18:40:35
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