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liujkbenben

银虫 (小有名气)

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[求助] 请大家指点如何做两化合物的相互作用？

将化合物1和化合物2分别用B3LYP进行了构型优化，优化好的构型用chem3D调好距离和位置，再用GaussianView存为gjf文件，这个gif文件要改哪些参数呢？请大家指点？

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1楼2011-04-19 21:32:22

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vanghaitao

木虫 (小有名气)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★
zhou2009(金币+3): 2011-04-21 08:50:08

引用回帖:

Originally posted by liujkbenben at 2011-04-19 21:32:22:
将化合物1和化合物2分别用B3LYP进行了构型优化，优化好的构型用chem3D调好距离和位置，再用GaussianView存为gjf文件，这个gif文件要改哪些参数呢？请大家指点？

B3LYP不能用于弱相互作用体系。改用DFT-D, M062x比较好, 分别在turbmole 和 G09里有。关于这两种泛函，请参考原始文献： S. Grimme, J. Comput. Chem., 2004, 25, 1463, (DFT-D);
10 Y. Zhao and D. G. Trublar, Theor. Chem. Acc., 2008, 120, 215 (M06).

counterpoise=2 是需要的，去除BSSE.