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nihao000

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 非晶态淬火建模求助!!

过程是这样:
(1)一个简单立方盒子64个C原子
(2), 在0.5ps内温度从300k迅速升高到5000k,然后开始进行液体平衡过程
  (3)5000k平衡0.5ps
  (4)0.5ps内 5000k到1K淬火,形成非晶结构。

我用Amorphous Cell Construction 建模    过程是这样
  先在一个3D Atomistic Document 画一个C原子。
然后用AC Construction 加入64个原子。
用discover NVT系宗,完成以上淬火过程。

问题出来了:无论哪一步,都是单个的C原子,根本没有键啊!!我用bond option 加了键,但是键长不确定,感觉没什么意义,竟然还出现一个C上有5个键的。
希望高手给予回答!!

[ Last edited by nihao000 on 2011-4-19 at 17:18 ]
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nihao000

铁杆木虫 (著名写手)

哪位高手能帮忙解释一下啊
2楼2011-04-19 17:24:18
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nihao000

铁杆木虫 (著名写手)

希望有高人解释。
每天一顶
3楼2011-04-20 07:50:20
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nihao000

铁杆木虫 (著名写手)


哪位大侠帮助一下啊!

接着顶!
4楼2011-04-21 09:49:53
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acridine

木虫 (正式写手)


franch(金币+1): 谢谢回帖交流 2011-04-21 19:52:32
这个模块应该是只有原子连上键才考虑之间的力场吧,而且一些力场似乎无法考虑断键、成键的过程。这些都值得注意
5楼2011-04-21 17:45:55
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nihao000

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by acridine at 2011-04-21 17:45:55:
这个模块应该是只有原子连上键才考虑之间的力场吧,而且一些力场似乎无法考虑断键、成键的过程。这些都值得注意

哦,谢谢你。

怎么解决?

哪个模块能自动成键?

难道用 typing中的 手动分配力场类型?这与液相淬火建模目的不相符啊。
液相淬火建模的目的就是为了找出各种配位,各种结构,希望在这个过程中的相变能产生非晶结构。
希望能给予回答!
那个模块能成键呢
6楼2011-04-22 07:52:06
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acridine

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
gzqdyouxia(金币+2): 谢谢提示 2011-04-22 17:13:14
nihao000(金币+5): 谢谢指点!!感激不尽 2011-04-23 10:50:51
nihao000(金币+5): 2011-04-25 18:18:20
引用回帖:
Originally posted by nihao000 at 2011-04-22 07:52:06:
哦,谢谢你。

怎么解决?

哪个模块能自动成键?

难道用 typing中的 手动分配力场类型?这与液相淬火建模目的不相符啊。
液相淬火建模的目的就是为了找出各种配位,各种结构,希望在这个过程中的相变 ...

第一原理的模块肯定是没有问题的,不过需要考虑计算量的问题。
一些经验势,如tersoff模型,也常常被用来模拟非晶形成的过程。MS中有个模块有这个势,但没具体的使用过,不知道能不能实现你所说的MD过程。搜索下help吧。
力场相关的这些模块不熟,只是知道有些力场不能考虑成键过程,所以提醒你注意。至于你选择的力场是否适用,最好看看相关文献
7楼2011-04-22 15:53:43
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humeng0811

木虫 (正式写手)

你的问题解决了吗?怎么解决的?
静静的百合盛开在静静的山谷中莫问花为谁开香为谁浓它只兀自绽放它的美丽快乐着它的快乐悲伤着它的悲伤或许孤单但并不寂寞或许惆怅却并不迷茫~~
8楼2013-08-22 11:12:48
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wdwhsfy

木虫 (小有名气)

求助~~楼主,你好,我现在在做无机玻璃的分子动力学模拟,建模过程也是画了原子后用AC加入到一个立方盒子里,然后淬火,同样的问题也是没有键,请问你当时的问题是怎么解决的呢?望帮助解答,非常感谢!
9楼2014-07-08 16:05:13
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