24小时热门版块排行榜    

查看: 8748  |  回复: 27

yongma2008

木虫 (著名写手)

论文?苦!主。


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
最近正好在做跟这个有些相关的,学习了
21楼2011-10-10 16:16:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liuying287

禁言 (正式写手)

送鲜花一朵
本帖内容被屏蔽

22楼2012-03-11 16:56:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

喻儿在线

金虫 (小有名气)

很不愿意努力但必须努力的大喵


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
:jok作者笔锋很幽默嘛~~~哈哈
一旦开始就不要害怕!
23楼2012-12-04 21:31:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
896208楼: Originally posted by sobereva at 2011-04-18 00:46:49
注意此文只是我不负责任随便说说,完全不系统、全面、客观,所以称为“乱谈”。由于懒于措辞和整理文章结构,极有可能使读者造成误会,内容可信度仅当小道消息视之即可。我不希望此文误人子弟,所以其实也本不希望被 ...

sob姐,打扰了,请教个问题:我的体系是104个原子的酶活性中心,氨基酸残基之间有很多的氢键形成,用这个模型来算各条反应机理。那么我读了您的文章,结合我的12个核的曙光节点,初步考虑的是:分别用m062x,DFT-D,wb97X-D,基组是6-311+g(d),同时用int=fine,请问我的思路有问题吗?请点评,谢谢
为了自己的目标而奋斗,一切皆有可能
24楼2013-04-04 17:22:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1293741楼: Originally posted by 游子8921 at 2013-04-04 17:22:43
sob姐,打扰了,请教个问题:我的体系是104个原子的酶活性中心,氨基酸残基之间有很多的氢键形成,用这个模型来算各条反应机理。那么我读了您的文章,结合我的12个核的曙光节点,初步考虑的是:分别用m062x,DFT-D ...

思路没什么问题,只要能算得动就行。M062X和wB97XD当中取其一就行了,其它的DFT-D没必要考虑,除非是想让结论更有说服力一些,可以多比较几种。如果计算量太大,用MOPAC2012最新支持的PM7做优化是个很好的选择。
25楼2013-04-04 18:32:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

游子8921

铁杆木虫 (知名作家)

游子8921


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
1293744楼: Originally posted by sobereva at 2013-04-04 18:32:59
思路没什么问题,只要能算得动就行。M062X和wB97XD当中取其一就行了,其它的DFT-D没必要考虑,除非是想让结论更有说服力一些,可以多比较几种。如果计算量太大,用MOPAC2012最新支持的PM7做优化是个很好的选择。...

sob姐,再请教。MOPAC2012没有接触过,PM7是半经验方法吗?若用PM7,优化效果要好于b3lyp/6-31g(d)吗?我看了MOPAC2012官网上关于PM7优化蛋白质的一些数值,但是相对于PM6的。我的理解应该有错误,请sob姐纠正,谢谢
为了自己的目标而奋斗,一切皆有可能
26楼2013-04-04 22:43:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

sobereva

至尊木虫 (著名写手)

本人已永久离开小木虫



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
26楼: Originally posted by 游子8921 at 2013-04-04 22:43:56
sob姐,再请教。MOPAC2012没有接触过,PM7是半经验方法吗?若用PM7,优化效果要好于b3lyp/6-31g(d)吗?我看了MOPAC2012官网上关于PM7优化蛋白质的一些数值,但是相对于PM6的。我的理解应该有错误,请sob姐纠正, ...

是半经验。比PM6在弱相互作用的计算上有飞跃性的改进。当弱相互作用比较重要时,优化效果比B3LYP/6-31G*要好。另外还有个PM7-TS,专门用于计算过渡态。
详见J Mol Model (2013) 19:1–32
27楼2013-04-05 14:45:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

516518

铜虫 (小有名气)

高手就是不一般
28楼2014-10-02 09:08:03
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 鱼妃 的主题更新
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +55 医学老男孩 2026-08-13 123/6150 2026-08-19 23:44 by stan_et
[基金申请] 今天基金会出结果吗?20260819 +13 kkkl_v 2026-08-19 13/650 2026-08-19 22:37 by 宝贝虫子
[基金申请] 时间戳变了,能看出什么问题? +12 基诺咪客 2026-08-17 16/800 2026-08-19 22:04 by kk 的小木虫
[基金申请] filecode,4个jtjc了 +11 ziyangfang 2026-08-19 13/650 2026-08-19 21:28 by aasahr
[基金申请] 今天放榜没戏了吧 +4 yuleib84 2026-08-19 5/250 2026-08-19 19:52 by hhs666
[基金申请] 今天放榜吗? +14 布布和一二 2026-08-19 15/750 2026-08-19 18:07 by gltch
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 快农历七夕节了,轻松一下,男人悄悄话,女施主请不要进来。 +6 Tide man 2026-08-14 7/350 2026-08-19 09:56 by ZJTJZ
[基金申请] 什么时候开奖? +6 CrisMessi 2026-08-18 6/300 2026-08-19 08:06 by Equinoxhua
[基金申请] 重要消息,中午系统在维护 +10 yuleib84 2026-08-18 11/550 2026-08-19 07:30 by 羽毛枫f
[基金申请] 明天放榜? +5 Shxjjxjkx 2026-08-18 5/250 2026-08-18 18:14 by -大大大大大-
[论文投稿] 投稿咨询 +4 wwm09 2026-08-17 6/300 2026-08-18 15:36 by wwm09
[基金申请] 时间戳又变了8-15 +14 archvillain 2026-08-15 26/1300 2026-08-18 13:37 by phantomgost
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +13 Ldrop2023 2026-08-13 16/800 2026-08-18 12:25 by 淀粉搬运工
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +4 且听虎啸 2026-08-17 5/250 2026-08-18 00:49 by 蔡棒棒菂
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +6 angus9576 2026-08-17 11/550 2026-08-17 23:57 by angus9576
[基金申请] 今天系统多次维护,明天很可能放榜! +8 zju2000 2026-08-16 9/450 2026-08-17 12:20 by lmz0216
[精细化工] 招聘 金属平磨液,抛光液研发工程师 +3 小天0311 2026-08-14 3/150 2026-08-16 07:31 by H9PLUS
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
信息提示
请填处理意见